276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2707 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2707  UspA domain-containing protein  100 
 
 
279 aa  558  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2866  UspA domain-containing protein  34.78 
 
 
276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2427  UspA domain-containing protein  35.04 
 
 
275 aa  113  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.420316  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  28.62 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  27.35 
 
 
298 aa  67  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  29.39 
 
 
278 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0262  UspA domain protein  29.07 
 
 
279 aa  62.8  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542285  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  26.19 
 
 
300 aa  62.4  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  30.7 
 
 
298 aa  62.4  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  30.04 
 
 
288 aa  61.6  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  29.6 
 
 
281 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  25.61 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  31 
 
 
301 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
325 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0609  UspA domain protein  23.79 
 
 
283 aa  60.1  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  32.31 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  30.73 
 
 
303 aa  59.3  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  25.43 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  30.7 
 
 
281 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  24.14 
 
 
297 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  27.52 
 
 
293 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0990  hypothetical protein  30.94 
 
 
277 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1008  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 
277 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1018  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 
277 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  31.18 
 
 
280 aa  56.2  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  27.75 
 
 
282 aa  56.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  31.6 
 
 
280 aa  56.2  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  28.67 
 
 
148 aa  55.8  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2015  universal stress protein UspE  25.77 
 
 
310 aa  55.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000455059 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1960  universal stress protein UspE  25.77 
 
 
310 aa  55.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00778314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2116  universal stress protein UspE  25.77 
 
 
310 aa  55.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.673331  normal  0.0394292 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2355  universal stress protein UspE  25.77 
 
 
310 aa  55.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0336  hypothetical protein  22.81 
 
 
284 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159298  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  27.76 
 
 
294 aa  55.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  26.19 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  26.2 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  27.04 
 
 
301 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  27.31 
 
 
281 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6234  UspA domain-containing protein  32.29 
 
 
316 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894885  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  29.09 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  29.67 
 
 
305 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  26.67 
 
 
301 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  39.68 
 
 
274 aa  53.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  33.58 
 
 
138 aa  53.5  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1767  hypothetical protein  27.07 
 
 
282 aa  53.1  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  27.35 
 
 
323 aa  53.1  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  27.86 
 
 
147 aa  52.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  28.7 
 
 
286 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  32.97 
 
 
154 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5077  UspA domain protein  31.69 
 
 
156 aa  52.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.903375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  26.85 
 
 
301 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  34.31 
 
 
151 aa  52.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  24.69 
 
 
295 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  28.05 
 
 
292 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
145 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  44.78 
 
 
138 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  28.26 
 
 
286 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  27.03 
 
 
159 aa  52  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  35.11 
 
 
148 aa  51.6  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  27.91 
 
 
293 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  38.54 
 
 
145 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 
145 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  41.54 
 
 
170 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  32.17 
 
 
141 aa  50.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  27.02 
 
 
293 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2377  UspA domain protein  21.43 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126775  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  27.02 
 
 
293 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  27.8 
 
 
291 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  32.32 
 
 
162 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1861  hypothetical protein  28.48 
 
 
282 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  42.42 
 
 
138 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  47.37 
 
 
309 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0776  UspA domain protein  31.37 
 
 
570 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  31.43 
 
 
140 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  24.75 
 
 
294 aa  50.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  31.43 
 
 
140 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  38.98 
 
 
160 aa  50.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  26.35 
 
 
297 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 
293 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 
293 aa  49.7  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  38.95 
 
 
301 aa  49.7  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  34.78 
 
 
173 aa  49.7  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  29.26 
 
 
291 aa  49.7  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
324 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  34.04 
 
 
140 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4578  UspA domain-containing protein  32.54 
 
 
218 aa  49.3  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.911716  decreased coverage  0.000114407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  26.23 
 
 
309 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2918  UspA domain-containing protein  27.66 
 
 
297 aa  48.9  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519295 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  32.86 
 
 
143 aa  48.9  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  42.65 
 
 
297 aa  48.9  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  47.17 
 
 
157 aa  48.9  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  28.46 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  50.91 
 
 
147 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  26.41 
 
 
286 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2471  UspA domain protein  32.35 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.584159  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0473  hypothetical protein  25.94 
 
 
282 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.203309  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  24.43 
 
 
314 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  31.92 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1559  UspA domain protein  31.62 
 
 
147 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.411505 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  36.36 
 
 
170 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>