278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2471 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2471  UspA domain protein  100 
 
 		 283 aa  573  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.584159  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  32.51 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  29.5 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  27.96 
 
 		 282 aa  85.9  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  28.24 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  29.79 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  26.96 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  34.44 
 
 		 155 aa  68.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  31.82 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  34.85 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  32.09 
 
 		 147 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  31.06 
 
 		 145 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  27.99 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  32.39 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  32.31 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  34.09 
 
 		 171 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  31.82 
 
 		 168 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  28.27 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  34.78 
 
 		 149 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  29.66 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  32.82 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  34.11 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  30.56 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  32.82 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  32.82 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  32.82 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  32.82 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  32.82 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  32.82 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  32.82 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  32.82 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1859  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.53 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  29.66 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  31.25 
 
 		 147 aa  58.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 149 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  33.58 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  29.77 
 
 		 145 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 147 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  31.06 
 
 		 144 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  29.93 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  31.06 
 
 		 144 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  31.34 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.53 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  30.56 
 
 		 147 aa  57  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  34.78 
 
 		 156 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  26.41 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  28.42 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  31.34 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  36.64 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  29.77 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  32 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  32.84 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  28.24 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  29.8 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  32.24 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.06 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  29.8 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  30.94 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  32.09 
 
 		 138 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  25.86 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  22.26 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  31.91 
 
 		 149 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  26.71 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  31.34 
 
 		 144 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  29.1 
 
 		 147 aa  53.9  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  31.94 
 
 		 147 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  31.3 
 
 		 144 aa  53.5  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  27.48 
 
 		 149 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  32.82 
 
 		 141 aa  53.9  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  28.89 
 
 		 155 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  33.33 
 
 		 144 aa  53.9  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  30.23 
 
 		 144 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  31.43 
 
 		 145 aa  53.1  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  27.48 
 
 		 145 aa  52.8  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  24.48 
 
 		 288 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  27.09 
 
 		 294 aa  52.4  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  29.85 
 
 		 144 aa  52.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  29.93 
 
 		 154 aa  52.4  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  29.85 
 
 		 144 aa  52.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 		 147 aa  52.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  27.27 
 
 		 287 aa  52.4  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  26.87 
 
 		 320 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1055  universal stress protein  28.89 
 
 		 148 aa  51.6  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  25.34 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.13 
 
 		 142 aa  52  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  29.77 
 
 		 151 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 144 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  25.17 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0994  universal stress protein  28.89 
 
 		 148 aa  51.6  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  29.01 
 
 		 147 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  31.62 
 
 		 143 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  29.5 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 		 172 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  24.53 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  28.39 
 
 		 325 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  29.71 
 
 		 140 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  26.53 
 
 		 148 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>