35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2377 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2377  UspA domain protein  100 
 
 		 266 aa  548  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0609  UspA domain protein  24.91 
 
 		 283 aa  89.7  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0161  UspA domain-containing protein  26.55 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  24.35 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  24.14 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2707  UspA domain-containing protein  21.43 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  25.11 
 
 		 303 aa  49.3  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  21.69 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  24.06 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0262  UspA domain protein  25.97 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542285  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  42 
 
 		 144 aa  47  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1649  UspA domain-containing protein  25.86 
 
 		 305 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  30.43 
 
 		 151 aa  46.6  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  25.42 
 
 		 281 aa  46.2  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  37.93 
 
 		 142 aa  45.4  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1843  universal stress protein  27.59 
 
 		 153 aa  45.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.120416  normal  0.660633 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  23.65 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0504  UspA domain-containing protein  39.39 
 
 		 151 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00200377  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2130  hypothetical protein  27.59 
 
 		 153 aa  45.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  42.55 
 
 		 160 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  27.89 
 
 		 166 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  32.31 
 
 		 145 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  42.86 
 
 		 145 aa  43.5  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3342  hypothetical protein  40 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  44.9 
 
 		 145 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  42 
 
 		 164 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  36.23 
 
 		 162 aa  43.5  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2095  UspA domain-containing protein  32.11 
 
 		 320 aa  42.7  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  24.42 
 
 		 282 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0547  UspA domain protein  24.34 
 
 		 253 aa  42.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  0.138657 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  22.65 
 
 		 290 aa  42.7  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  32.58 
 
 		 157 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  29.5 
 
 		 159 aa  42.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  35.82 
 
 		 159 aa  42  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4990  UspA domain protein  30.3 
 
 		 285 aa  42  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>