29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0161 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0161  UspA domain-containing protein  100 
 
 
276 aa  557  1e-158  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0609  UspA domain protein  28.42 
 
 
283 aa  123  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2377  UspA domain protein  26.55 
 
 
266 aa  67  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126775  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2866  UspA domain-containing protein  23.83 
 
 
276 aa  58.9  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  28.92 
 
 
285 aa  58.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  21.4 
 
 
283 aa  55.5  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  23.65 
 
 
278 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1433  GCN5-related N-acetyltransferase  27.41 
 
 
412 aa  53.5  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.378287  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  24.38 
 
 
281 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2145  UspA domain protein  24.9 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  28.1 
 
 
170 aa  49.3  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0262  UspA domain protein  24.52 
 
 
279 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542285  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  28.03 
 
 
140 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  31.78 
 
 
390 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  29.11 
 
 
297 aa  46.6  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  40 
 
 
140 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  25.89 
 
 
288 aa  46.2  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  24.64 
 
 
140 aa  46.2  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  20 
 
 
296 aa  45.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  31.06 
 
 
164 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  24.47 
 
 
293 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  25 
 
 
301 aa  43.9  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  33.33 
 
 
148 aa  43.9  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2547  UspA domain-containing protein  28.4 
 
 
166 aa  43.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.903802  hitchhiker  0.00000022804 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  27.46 
 
 
145 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0336  hypothetical protein  26.71 
 
 
284 aa  43.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159298  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  27.72 
 
 
287 aa  43.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  19.58 
 
 
274 aa  43.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  27.78 
 
 
310 aa  42.7  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>