79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0609 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0609  UspA domain protein  100 
 
 
283 aa  577  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0161  UspA domain-containing protein  28.42 
 
 
276 aa  123  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2377  UspA domain protein  24.91 
 
 
266 aa  89.7  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126775  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  25 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  23.1 
 
 
283 aa  65.5  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  22.85 
 
 
301 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2707  UspA domain-containing protein  23.79 
 
 
279 aa  58.9  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  20.3 
 
 
281 aa  55.8  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  21.97 
 
 
287 aa  55.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2427  UspA domain-containing protein  21.43 
 
 
275 aa  54.7  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.420316  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  24.67 
 
 
314 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  21.52 
 
 
289 aa  53.1  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2866  UspA domain-containing protein  20.95 
 
 
276 aa  52.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  20.89 
 
 
305 aa  52.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  26.89 
 
 
286 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  26.89 
 
 
286 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  20.07 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  21.12 
 
 
297 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  27.69 
 
 
297 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  20.86 
 
 
295 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  23.13 
 
 
170 aa  49.3  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  31.33 
 
 
146 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2145  UspA domain protein  21.85 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  21.07 
 
 
294 aa  48.5  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  19.85 
 
 
301 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0262  UspA domain protein  21.64 
 
 
279 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542285  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  28.97 
 
 
142 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  23.13 
 
 
155 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  22.87 
 
 
282 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  24.46 
 
 
147 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  28 
 
 
138 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3796  UspA domain protein  26.12 
 
 
139 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  20.72 
 
 
297 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  25.52 
 
 
149 aa  46.2  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  26.95 
 
 
147 aa  45.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0095  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 
157 aa  45.8  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  41.18 
 
 
280 aa  45.8  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  28.57 
 
 
150 aa  45.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  19.87 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  25.53 
 
 
140 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  25.17 
 
 
170 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  25.17 
 
 
170 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  27.73 
 
 
141 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  20.17 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  25.23 
 
 
304 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3344  UspA domain protein  25.18 
 
 
141 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225845  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  35.71 
 
 
149 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2877  UspA domain protein  22.56 
 
 
300 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  32.89 
 
 
159 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1040  UspA domain protein  20.8 
 
 
281 aa  43.9  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0924435  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  26.76 
 
 
152 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0574  UspA domain protein  29.35 
 
 
303 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  32.35 
 
 
149 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0850  universal stress protein UspA  26.32 
 
 
146 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.789221  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1445  UspA domain protein  28.19 
 
 
144 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228504  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  32.53 
 
 
308 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  24.12 
 
 
317 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  38.33 
 
 
145 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  19.58 
 
 
295 aa  43.5  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  24.32 
 
 
151 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  24.11 
 
 
147 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0336  hypothetical protein  23.74 
 
 
284 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159298  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4854  UspA domain-containing protein  21.52 
 
 
286 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4244  UspA domain-containing protein  27.33 
 
 
144 aa  43.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  25 
 
 
147 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  38.33 
 
 
145 aa  43.1  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3554  UspA domain-containing protein  22.56 
 
 
300 aa  43.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125802  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  25 
 
 
147 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  38.33 
 
 
145 aa  43.1  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0065  UspA domain protein  24.44 
 
 
143 aa  43.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  32.95 
 
 
221 aa  43.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  22.38 
 
 
156 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2183  universal stress family protein  23.74 
 
 
143 aa  42.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0396  hypothetical protein  21.55 
 
 
282 aa  42.7  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1841  UspA domain protein  23.74 
 
 
143 aa  42.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  24.82 
 
 
139 aa  42.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  26.03 
 
 
145 aa  42.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  34.29 
 
 
154 aa  42.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  25.17 
 
 
169 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>