More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_4244 on replicon NC_009425
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009425  Ent638_4244  UspA domain-containing protein  100 
 
 
144 aa  289  9e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1773  universal stress protein F  62.5 
 
 
144 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.633651  normal  0.0944552 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1771  universal stress protein F  62.5 
 
 
144 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0837729 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1502  universal stress protein F  62.5 
 
 
144 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432099  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1834  universal stress protein F  62.5 
 
 
144 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1685  universal stress protein F  62.5 
 
 
144 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1777  universal stress protein F  63.89 
 
 
144 aa  187  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1994  universal stress protein F  63.89 
 
 
144 aa  187  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1613  universal stress protein F  63.89 
 
 
144 aa  187  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1559  universal stress protein F  63.19 
 
 
144 aa  187  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01347  stress-induced protein, ATP-binding protein  63.19 
 
 
144 aa  185  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2270  UspA domain protein  63.19 
 
 
144 aa  185  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397995  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01359  hypothetical protein  63.19 
 
 
144 aa  185  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1462  universal stress protein F  63.19 
 
 
144 aa  185  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.694319  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2280  UspA domain-containing protein  63.19 
 
 
144 aa  185  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  46.21 
 
 
143 aa  124  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2836  UspA domain protein  47.59 
 
 
142 aa  122  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2532  UspA domain protein  46.9 
 
 
142 aa  122  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1834  UspA domain-containing protein  46.21 
 
 
142 aa  121  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52305  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2676  UspA domain protein  44.83 
 
 
142 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0693  universal stress protein G  40.97 
 
 
142 aa  101  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.727878  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0659  universal stress protein G  40.97 
 
 
142 aa  101  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0628  universal stress protein G  40.97 
 
 
142 aa  101  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0628  universal stress protein G  40.28 
 
 
142 aa  101  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0521  universal stress protein G  41.22 
 
 
142 aa  100  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00576  universal stress protein UP12  40.28 
 
 
142 aa  100  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3017  UspA domain protein  40.28 
 
 
142 aa  100  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00565  hypothetical protein  40.28 
 
 
142 aa  100  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3036  UspA domain-containing protein  40.28 
 
 
142 aa  100  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2566  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31142  normal  0.160987 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1147  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
142 aa  94.4  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.280901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5541  putative universal stress protein (Usp)  40.28 
 
 
141 aa  94.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1445  UspA domain protein  36.81 
 
 
144 aa  87.8  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228504  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0031  UspA domain protein  36.73 
 
 
163 aa  85.1  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1937  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
143 aa  85.5  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2329  hypothetical protein  37.84 
 
 
143 aa  84  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727438  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1327  hypothetical protein  37.5 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1477  hypothetical protein  36.81 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41182  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0772  universal stress protein G  44.05 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0712  universal stress protein G  44.05 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.9695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0653  universal stress protein G  44.05 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0667  universal stress protein G  44.05 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.576414  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0726  universal stress protein G  44.05 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.678292  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3824  hypothetical protein  36.81 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186733  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  36.81 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1265  hypothetical protein  34.48 
 
 
136 aa  77.4  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3802  hypothetical protein  36.91 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.356211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0179  hypothetical protein  41.1 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3481  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3686  hypothetical protein  34.72 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.460591 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0609  hypothetical protein  35.42 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0479495  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  35.42 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2094  hypothetical protein  36.81 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2040  putative universal stress protein  35.17 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.190459  normal  0.175544 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  31.97 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  34.72 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  32.65 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0866  UspA domain protein  36.05 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0647651  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2213  putative UspA domain protein  31.94 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  31.47 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  31.29 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0994  UspA domain protein  31.29 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  30.34 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  31.91 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  33.56 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  31.79 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  31.58 
 
 
180 aa  62.8  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  27.66 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  32.24 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  35.29 
 
 
156 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  31.54 
 
 
143 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  31.54 
 
 
143 aa  61.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  40 
 
 
144 aa  60.8  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 
153 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  35.11 
 
 
300 aa  60.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  31.47 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  30.07 
 
 
152 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  32.88 
 
 
145 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  38.26 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  29.53 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  31.72 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  34.64 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  28 
 
 
150 aa  58.9  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0071  hypothetical protein  30.77 
 
 
308 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.677177  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0737  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543715  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2734  universal stress protein  31.29 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  45.83 
 
 
162 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  33.77 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  45.83 
 
 
162 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  51.67 
 
 
162 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  31.85 
 
 
177 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2686  universal stress protein  28.47 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0810478  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  40.48 
 
 
149 aa  57  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0603  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 
164 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  30.46 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0930  universal stress protein UspE  30.41 
 
 
311 aa  57.4  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 
149 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>