203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1445 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1445  UspA domain protein  100 
 
 		 144 aa  288  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228504  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2329  hypothetical protein  67.13 
 
 		 143 aa  205  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3802  hypothetical protein  58.87 
 
 		 141 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.356211  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3481  UspA domain-containing protein  58.87 
 
 		 141 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3686  hypothetical protein  57.45 
 
 		 141 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.460591 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0609  hypothetical protein  46.1 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0479495  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0179  hypothetical protein  45.77 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1250  hypothetical protein  41.26 
 
 		 143 aa  110  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.284687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0031  UspA domain protein  39.16 
 
 		 163 aa  103  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2532  UspA domain protein  35.21 
 
 		 142 aa  88.6  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2836  UspA domain protein  36.62 
 
 		 142 aa  88.6  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4244  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2676  UspA domain protein  36.05 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  36.36 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  33.1 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1834  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  29.58 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0628  universal stress protein G  33.57 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  30.28 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00576  universal stress protein UP12  32.87 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3017  UspA domain protein  32.87 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1115  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1773  universal stress protein F  31.76 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.633651  normal  0.0944552 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3036  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1771  universal stress protein F  31.76 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0837729 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00565  hypothetical protein  32.87 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1502  universal stress protein F  31.76 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432099  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0521  universal stress protein G  32.87 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1685  universal stress protein F  31.76 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2566  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31142  normal  0.160987 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1834  universal stress protein F  31.76 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0659  universal stress protein G  32.87 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0628  universal stress protein G  32.87 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0693  universal stress protein G  32.87 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.727878  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01347  stress-induced protein, ATP-binding protein  32.88 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2270  UspA domain protein  32.88 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397995  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1462  universal stress protein F  32.88 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.694319  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01359  hypothetical protein  32.88 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2280  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1559  universal stress protein F  32.88 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1613  universal stress protein F  32.88 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1777  universal stress protein F  32.88 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1994  universal stress protein F  32.88 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1327  hypothetical protein  30.5 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5541  putative universal stress protein (Usp)  31.21 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1477  hypothetical protein  31.91 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41182  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1147  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.280901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  31.94 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3824  hypothetical protein  31.25 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  28.17 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2734  universal stress protein  33.1 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  31.25 
 
 		 143 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1937  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0866  UspA domain protein  31.25 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0647651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2040  putative universal stress protein  36.3 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.190459  normal  0.175544 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0994  UspA domain protein  31.94 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2213  putative UspA domain protein  29.37 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  30.87 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  30.14 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0712  universal stress protein G  37.65 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.9695 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0726  universal stress protein G  37.65 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.678292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  31.79 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0772  universal stress protein G  37.65 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0653  universal stress protein G  37.65 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0667  universal stress protein G  37.65 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.576414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1352  hypothetical protein  40 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.486756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  30.56 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  28.28 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1265  hypothetical protein  31.76 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  31.47 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  32.19 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6366  UspA domain protein  28.47 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0890005  normal  0.312841 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  31.58 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  30.34 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  27.59 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  32.9 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3128  UspA domain protein  26.62 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.621978  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  34.23 
 
 		 303 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32.87 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  32.67 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2686  universal stress protein  30.61 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0810478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  31.82 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  34.48 
 
 		 296 aa  48.9  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  31.76 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  32.43 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  30.97 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  27.85 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  30.77 
 
 		 280 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  24.49 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2171  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.981815  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0603  UspA domain-containing protein  24.65 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1265  hypothetical protein  25.17 
 
 		 275 aa  47.4  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.995311  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2862  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  29.22 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  29.05 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  30.56 
 
 		 415 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>