21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3128 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3128  UspA domain protein  100 
 
 		 140 aa  286  7e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.621978  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0834  UspA domain-containing protein  57.25 
 
 		 141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2171  UspA domain-containing protein  46.76 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.981815  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2126  hypothetical protein  49.64 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0247  hypothetical protein  39.42 
 
 		 137 aa  103  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2686  universal stress protein  33.8 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0810478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1250  hypothetical protein  29.14 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.284687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1445  UspA domain protein  26.62 
 
 		 144 aa  50.8  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228504  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  30.46 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0031  UspA domain protein  26.28 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  24.5 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5541  putative universal stress protein (Usp)  27.27 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  24.5 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  26.49 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3824  hypothetical protein  27.21 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  24.82 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1477  hypothetical protein  26.06 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41182  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2329  hypothetical protein  25.83 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  24.65 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1265  hypothetical protein  28.57 
 
 		 136 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>