153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2686 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2686  universal stress protein  100 
 
 		 138 aa  276  8e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0810478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2171  UspA domain-containing protein  37.86 
 
 		 139 aa  93.6  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.981815  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2126  hypothetical protein  36.67 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0834  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3128  UspA domain protein  33.8 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.621978  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2836  UspA domain protein  35.92 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  36.55 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1477  hypothetical protein  35.62 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41182  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2532  UspA domain protein  36.36 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2213  putative UspA domain protein  33.81 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1327  hypothetical protein  32.62 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2676  UspA domain protein  35.21 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  30.82 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  32.89 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2040  putative universal stress protein  34.01 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.190459  normal  0.175544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3824  hypothetical protein  30.14 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0247  hypothetical protein  27.54 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1834  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5541  putative universal stress protein (Usp)  30.82 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2329  hypothetical protein  35.33 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4244  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  34.21 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  32.45 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0179  hypothetical protein  29.25 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0603  UspA domain-containing protein  26.35 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01347  stress-induced protein, ATP-binding protein  28.77 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2270  UspA domain protein  28.77 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397995  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01359  hypothetical protein  28.77 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1462  universal stress protein F  28.77 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.694319  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2280  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0031  UspA domain protein  29.53 
 
 		 163 aa  51.2  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1559  universal stress protein F  28.77 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1994  universal stress protein F  28.77 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1613  universal stress protein F  28.77 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1777  universal stress protein F  28.77 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  30.77 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1250  hypothetical protein  28.97 
 
 		 143 aa  50.4  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.284687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1685  universal stress protein F  26.8 
 
 		 144 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1834  universal stress protein F  26.8 
 
 		 144 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1771  universal stress protein F  26.8 
 
 		 144 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0837729 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1502  universal stress protein F  26.8 
 
 		 144 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432099  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1773  universal stress protein F  26.8 
 
 		 144 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.633651  normal  0.0944552 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0609  hypothetical protein  31.33 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0479495  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  30 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  32.43 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  31.51 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  31.21 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  27.59 
 
 		 276 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  36 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  36 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1445  UspA domain protein  30.61 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228504  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  36 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  30.32 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  32.89 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0994  UspA domain protein  28.77 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  31.29 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2566  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31142  normal  0.160987 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3802  hypothetical protein  30.82 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.356211  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  29.61 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3481  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  31.58 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1265  hypothetical protein  30.26 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  31.08 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  31.08 
 
 		 145 aa  47.4  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 		 164 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  30.2 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  30.38 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 		 167 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  34.67 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  30.97 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  30.2 
 
 		 291 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  25.81 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  35.66 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3686  hypothetical protein  51.06 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.460591 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0866  UspA domain protein  24.66 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0647651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  31.97 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0271  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 250 aa  44.7  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00141886  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  47.06 
 
 		 180 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  30.92 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  31.01 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  30.57 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  30.56 
 
 		 282 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0628  universal stress protein G  27.27 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  28.21 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1937  UspA domain-containing protein  26.97 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  31.41 
 
 		 173 aa  43.5  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  48 
 
 		 156 aa  43.5  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  33.61 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  46.81 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  29.8 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>