36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0834 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0834  UspA domain-containing protein  100 
 
 
141 aa  284  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3128  UspA domain protein  57.25 
 
 
140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.621978  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2171  UspA domain-containing protein  46.04 
 
 
139 aa  133  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.981815  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2126  hypothetical protein  48.18 
 
 
138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0247  hypothetical protein  38.69 
 
 
137 aa  101  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2686  universal stress protein  33.33 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0810478  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  29.33 
 
 
145 aa  57.4  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  28.19 
 
 
145 aa  52.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  28.67 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5541  putative universal stress protein (Usp)  27.97 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1250  hypothetical protein  25 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.284687  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1477  hypothetical protein  29.45 
 
 
141 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41182  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  27.33 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1834  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52305  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3824  hypothetical protein  25.35 
 
 
143 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186733  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  26.76 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  28.19 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  32.56 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  26.71 
 
 
143 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2329  hypothetical protein  25 
 
 
143 aa  43.9  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727438  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2566  UspA domain-containing protein  20.98 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31142  normal  0.160987 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  37.65 
 
 
164 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1445  UspA domain protein  25.53 
 
 
144 aa  41.6  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228504  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  24.14 
 
 
291 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  25.34 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0728  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  28.48 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  26.49 
 
 
151 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  24.83 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0609  hypothetical protein  24.66 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0479495  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0031  UspA domain protein  25.66 
 
 
163 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1584  UspA domain protein  24.29 
 
 
295 aa  40  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  29.49 
 
 
151 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>