21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0247 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0247  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  278  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2171  UspA domain-containing protein  38.85 
 
 
139 aa  104  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.981815  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3128  UspA domain protein  39.42 
 
 
140 aa  103  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.621978  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0834  UspA domain-containing protein  38.69 
 
 
141 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2126  hypothetical protein  37.96 
 
 
138 aa  99  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2686  universal stress protein  27.54 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0810478  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1477  hypothetical protein  28.28 
 
 
141 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41182  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3824  hypothetical protein  27.46 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186733  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  27.27 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  25.69 
 
 
143 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1327  hypothetical protein  28.47 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5541  putative universal stress protein (Usp)  25.87 
 
 
141 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1147  UspA domain-containing protein  27.45 
 
 
142 aa  45.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.280901 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2676  UspA domain protein  25.5 
 
 
142 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  31.09 
 
 
167 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1771  universal stress protein F  24.14 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0837729 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1834  universal stress protein F  24.14 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1773  universal stress protein F  24.14 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.633651  normal  0.0944552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1502  universal stress protein F  24.14 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432099  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1685  universal stress protein F  24.14 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0609  hypothetical protein  25.33 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0479495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>