More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1327 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1327  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  287  4e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1477  hypothetical protein  74.47 
 
 		 141 aa  230  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41182  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5541  putative universal stress protein (Usp)  76.43 
 
 		 141 aa  225  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  72.14 
 
 		 143 aa  213  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  72.14 
 
 		 143 aa  206  8e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3824  hypothetical protein  70.71 
 
 		 143 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2676  UspA domain protein  37.24 
 
 		 142 aa  100  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  36.55 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2532  UspA domain protein  39.31 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0521  universal stress protein G  37.06 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2836  UspA domain protein  39.31 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0628  universal stress protein G  37.06 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0693  universal stress protein G  37.06 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.727878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0659  universal stress protein G  37.06 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0628  universal stress protein G  37.06 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0031  UspA domain protein  38.19 
 
 		 163 aa  90.9  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00576  universal stress protein UP12  36.36 
 
 		 142 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3017  UspA domain protein  36.36 
 
 		 142 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00565  hypothetical protein  36.36 
 
 		 142 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3036  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 142 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1502  universal stress protein F  37.16 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432099  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1773  universal stress protein F  37.16 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.633651  normal  0.0944552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1685  universal stress protein F  37.16 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1834  universal stress protein F  37.16 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1771  universal stress protein F  37.16 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0837729 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1559  universal stress protein F  37.16 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1994  universal stress protein F  37.16 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1777  universal stress protein F  37.16 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1613  universal stress protein F  37.16 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01347  stress-induced protein, ATP-binding protein  37.16 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2270  UspA domain protein  37.16 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397995  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01359  hypothetical protein  37.16 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2280  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1462  universal stress protein F  37.16 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.694319  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1834  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1937  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4244  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2566  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31142  normal  0.160987 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0609  hypothetical protein  34.97 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0479495  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1265  hypothetical protein  38.57 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1147  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.280901 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  36.81 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2213  putative UspA domain protein  34.29 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0866  UspA domain protein  35.46 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0647651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0179  hypothetical protein  34.04 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  37.5 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2329  hypothetical protein  32.88 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0994  UspA domain protein  34.75 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1445  UspA domain protein  30.5 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228504  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2734  universal stress protein  32.14 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  35.17 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2040  putative universal stress protein  35 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.190459  normal  0.175544 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  35.42 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3802  hypothetical protein  37.01 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.356211  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3481  UspA domain-containing protein  37.01 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  34.72 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2686  universal stress protein  32.62 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0810478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3686  hypothetical protein  32.47 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.460591 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0603  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  36.24 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  30.82 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 145 aa  62  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0712  universal stress protein G  37.65 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.9695 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0726  universal stress protein G  37.65 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.678292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3570  UspA domain protein  34.46 
 
 		 271 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610605 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  34.21 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0667  universal stress protein G  37.65 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.576414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0772  universal stress protein G  37.65 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0653  universal stress protein G  37.65 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  31.43 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  33.77 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  35.76 
 
 		 304 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  32.65 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  34.67 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  32.67 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  28.77 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  34.25 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  34.04 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  32 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  30.87 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1250  hypothetical protein  26.06 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.284687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  29.37 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1352  hypothetical protein  34.27 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.486756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  30.92 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  29.37 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  32.65 
 
 		 280 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  29.45 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6366  UspA domain protein  29.29 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0890005  normal  0.312841 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2171  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.981815  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  31.54 
 
 		 276 aa  53.9  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>