75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2171 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2171  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 139 aa  283  5.999999999999999e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.981815  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0834  UspA domain-containing protein  46.04 
 
 		 141 aa  133  7.000000000000001e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3128  UspA domain protein  46.76 
 
 		 140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.621978  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2126  hypothetical protein  47.86 
 
 		 138 aa  115  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0247  hypothetical protein  38.85 
 
 		 137 aa  104  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2686  universal stress protein  37.86 
 
 		 138 aa  93.6  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0810478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5541  putative universal stress protein (Usp)  33.33 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0031  UspA domain protein  33.1 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3824  hypothetical protein  30.61 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1477  hypothetical protein  30.99 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41182  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1327  hypothetical protein  29.86 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0179  hypothetical protein  30.56 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  29.25 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  29.86 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1250  hypothetical protein  25.97 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.284687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2040  putative universal stress protein  31.76 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.190459  normal  0.175544 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0609  hypothetical protein  29.49 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0479495  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1147  UspA domain-containing protein  26.35 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.280901 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1937  UspA domain-containing protein  26.85 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  29.22 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1685  universal stress protein F  33.78 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2836  UspA domain protein  33.56 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1502  universal stress protein F  33.78 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432099  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1773  universal stress protein F  33.78 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.633651  normal  0.0944552 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1834  universal stress protein F  33.78 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1771  universal stress protein F  33.78 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0837729 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1445  UspA domain protein  29.41 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228504  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  27.74 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1462  universal stress protein F  33.11 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.694319  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2280  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01359  hypothetical protein  33.11 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2270  UspA domain protein  33.11 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397995  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01347  stress-induced protein, ATP-binding protein  33.11 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1265  hypothetical protein  28.67 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1559  universal stress protein F  33.11 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1613  universal stress protein F  33.11 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  27.63 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1994  universal stress protein F  33.11 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  30.26 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  28.95 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  29.53 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1777  universal stress protein F  33.11 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2532  UspA domain protein  31.08 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2329  hypothetical protein  28.76 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2676  UspA domain protein  29.25 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  29.49 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1834  UspA domain-containing protein  29.19 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  28.67 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0628  universal stress protein G  26.85 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  25.5 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  28.86 
 
 		 145 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  28.86 
 
 		 145 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00576  universal stress protein UP12  24 
 
 		 142 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  29.33 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3017  UspA domain protein  24 
 
 		 142 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00565  hypothetical protein  24 
 
 		 142 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  29.41 
 
 		 168 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3036  UspA domain-containing protein  24 
 
 		 142 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  27.15 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  28.57 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  29.45 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0693  universal stress protein G  26.17 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.727878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0659  universal stress protein G  26.17 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0742  UspA domain-containing protein  25.36 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4244  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2566  UspA domain-containing protein  27.92 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31142  normal  0.160987 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0521  universal stress protein G  26.17 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  26.49 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0628  universal stress protein G  26.17 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3263  UspA domain-containing protein  28.03 
 
 		 281 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0214365 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  26.67 
 
 		 151 aa  40  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  26.67 
 
 		 151 aa  40  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0603  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  26.53 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>