14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0742 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0742  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 141 aa  284  4e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1709  UspA domain-containing protein  78.72 
 
 		 141 aa  231  3e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.478002  normal  0.0298137 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0631  UspA domain-containing protein  75.89 
 
 		 141 aa  223  8e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0728  UspA domain-containing protein  72.34 
 
 		 139 aa  209  7e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1791  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.933223  normal  0.40622 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1612  UspA domain protein  30.22 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1651  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.825176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  28.37 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  30.34 
 
 		 297 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3570  UspA domain protein  27.08 
 
 		 271 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610605 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2171  UspA domain-containing protein  25.36 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.981815  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  27.52 
 
 		 140 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>