21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0631 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0631  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 141 aa  278  2e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1709  UspA domain-containing protein  78.01 
 
 		 141 aa  229  9e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.478002  normal  0.0298137 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0742  UspA domain-containing protein  75.89 
 
 		 141 aa  223  8e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0728  UspA domain-containing protein  72.34 
 
 		 139 aa  207  4e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1791  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 136 aa  72  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.933223  normal  0.40622 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1651  UspA domain-containing protein  32.85 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.825176  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1612  UspA domain protein  29.5 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  29.79 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  26.6 
 
 		 278 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  31.31 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 449 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2853  hypothetical protein  26.61 
 
 		 143 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.036432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  24.82 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  30.37 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  25.85 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  27.66 
 
 		 138 aa  40.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  29.66 
 
 		 297 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2862  UspA domain-containing protein  30.08 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>