140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1651 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1651  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 135 aa  273  7e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.825176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1791  UspA domain-containing protein  55.15 
 
 		 136 aa  169  9e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.933223  normal  0.40622 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1612  UspA domain protein  55.15 
 
 		 136 aa  169  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0728  UspA domain-containing protein  30.37 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0631  UspA domain-containing protein  32.85 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0742  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1709  UspA domain-containing protein  31.16 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.478002  normal  0.0298137 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  26.24 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.11 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  30.34 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  30.34 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  30.34 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  30.34 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  30.34 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  30.34 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  30.34 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  26.03 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  28.57 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  29.86 
 
 		 155 aa  50.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  27.97 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0646  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  28.47 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  29.66 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  28.66 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  30.71 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  26.35 
 
 		 282 aa  49.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  25.9 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  29.86 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  27.14 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  27.34 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  27.78 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  26.95 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  28.91 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1531  UspA domain protein  28.06 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00154671  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  29.61 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  24.83 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  28.57 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  28.68 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  26.21 
 
 		 274 aa  46.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  28.87 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  28.03 
 
 		 308 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  24.83 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  31.03 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  27.34 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  26.28 
 
 		 275 aa  45.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  27.34 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6028  hypothetical protein  28.57 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2049  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765605  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 291 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  27.34 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4067  UspA domain-containing protein  29.32 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2068  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960208  normal  0.914393 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  28.26 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  26.57 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  26.57 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  26.39 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  29.58 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  24.82 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  30.34 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  27.59 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  27.08 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  27.46 
 
 		 313 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  27.14 
 
 		 180 aa  44.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  23.78 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  24.65 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  26.24 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  26.06 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  25.69 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 151 aa  43.5  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  26.43 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  24.65 
 
 		 276 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  27.13 
 
 		 324 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  25.85 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  28.08 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.28 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  25.56 
 
 		 293 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  29.69 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  25.36 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  28.08 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  45.45 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>