151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1791 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1791  UspA domain-containing protein  100 
 
 
136 aa  270  7e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.933223  normal  0.40622 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1612  UspA domain protein  87.5 
 
 
136 aa  249  1e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1651  UspA domain-containing protein  55.15 
 
 
135 aa  169  9e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.825176  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0728  UspA domain-containing protein  36.69 
 
 
139 aa  88.6  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1709  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.478002  normal  0.0298137 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0742  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0631  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
138 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0646  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
151 aa  61.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  31.88 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  30.95 
 
 
128 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  30.37 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  28.46 
 
 
293 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  28.06 
 
 
139 aa  54.7  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2372  UspA domain protein  26.15 
 
 
293 aa  54.3  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019406  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1284  UspA family nucleotide-binding protein  30.07 
 
 
143 aa  53.5  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.176075  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  29.37 
 
 
148 aa  52  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  27.59 
 
 
139 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 
145 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  26.28 
 
 
140 aa  52  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  27.54 
 
 
141 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  28.06 
 
 
415 aa  51.2  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  31.43 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  28.78 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  31.78 
 
 
283 aa  51.2  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  28.87 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  26.75 
 
 
164 aa  50.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  27.66 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  27.66 
 
 
320 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  30.94 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  27.78 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  25.64 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  30.66 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 
274 aa  48.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  26.28 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  42 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  25.52 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2436  UspA domain-containing protein  42 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.236391 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  42 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  28.37 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  50 
 
 
155 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  27.82 
 
 
297 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  24.83 
 
 
314 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  24.82 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  42 
 
 
140 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0089  Sodium/hydrogen exchanger  30.89 
 
 
543 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  27.94 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  25.16 
 
 
515 aa  47  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  27.74 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  25.9 
 
 
150 aa  45.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  25.71 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  29.77 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  25.33 
 
 
287 aa  45.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  28.23 
 
 
291 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  25.69 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1910  UspA domain protein  29.6 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.718457  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  27.34 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  25.17 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  24.29 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  25.87 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  24.14 
 
 
282 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  24.26 
 
 
305 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  27.74 
 
 
286 aa  44.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  23.4 
 
 
304 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2742  hypothetical protein  25.16 
 
 
157 aa  44.3  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  24.11 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  28.87 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  24.66 
 
 
153 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  26.39 
 
 
276 aa  44.3  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  27.01 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  25.55 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3749  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 
281 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.074776  hitchhiker  0.000110577 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0737  UspA domain-containing protein  24.64 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543715  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  29.08 
 
 
288 aa  43.9  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  23.61 
 
 
144 aa  42.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  27.46 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  23.61 
 
 
144 aa  42.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2532  UspA domain protein  28.06 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  25.69 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  25.52 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  23.61 
 
 
144 aa  42.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  23.61 
 
 
144 aa  42.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  23.61 
 
 
144 aa  42.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  23.61 
 
 
144 aa  42.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  23.61 
 
 
144 aa  42.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  27.14 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  25.34 
 
 
167 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  25.17 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  25.17 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0245  universal stress protein  28.39 
 
 
370 aa  42.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2836  UspA domain protein  28.78 
 
 
142 aa  42  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  26.43 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>