292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3749 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3749  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 281 aa  575  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.074776  hitchhiker  0.000110577 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3263  UspA domain-containing protein  85.77 
 
 		 281 aa  504  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0214365 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  29.63 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  31.72 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  30.22 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  27.51 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  27.66 
 
 		 159 aa  67  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  32.39 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  31.72 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  27.15 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  25.76 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  30.5 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  33.79 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  29.58 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  28.83 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  29.8 
 
 		 149 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  28.97 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  29.35 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  28.86 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  29.66 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  27.4 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  31.25 
 
 		 159 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 145 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4067  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 137 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  25.42 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  30.71 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  28.37 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  26.21 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  30.63 
 
 		 151 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3585  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 150 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.666006  normal  0.0498222 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2708  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0505017  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  27.78 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  30.56 
 
 		 140 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  28.28 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  29.08 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  25.71 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  27.66 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  23.61 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  30.99 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  29.66 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  24.19 
 
 		 130 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  24.5 
 
 		 149 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  25.35 
 
 		 148 aa  55.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  30.13 
 
 		 160 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  28.57 
 
 		 145 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  22.6 
 
 		 139 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 		 140 aa  54.3  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  28 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  32.39 
 
 		 144 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  31.94 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  30.14 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  31.76 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  28.17 
 
 		 151 aa  53.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  29.63 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  27.46 
 
 		 156 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  25.29 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 144 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  26.24 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  26.57 
 
 		 153 aa  53.1  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  26.57 
 
 		 289 aa  53.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  29.58 
 
 		 305 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  24.09 
 
 		 286 aa  52.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  30.72 
 
 		 170 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  30.72 
 
 		 170 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  25.87 
 
 		 153 aa  52.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  23.61 
 
 		 145 aa  52.8  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  26.95 
 
 		 297 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  23.08 
 
 		 274 aa  52.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  29.08 
 
 		 147 aa  52.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1300  universal stress protein  29.67 
 
 		 108 aa  52  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.116083  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 138 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  28.95 
 
 		 153 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  24.14 
 
 		 149 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  31.37 
 
 		 169 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  28.95 
 
 		 153 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0504  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 151 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00200377  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  26.21 
 
 		 145 aa  52  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  28.19 
 
 		 145 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  32.86 
 
 		 141 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  26.95 
 
 		 140 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  24.65 
 
 		 147 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  25.52 
 
 		 145 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  28.29 
 
 		 153 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  29.08 
 
 		 138 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  23.4 
 
 		 144 aa  51.6  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  23.4 
 
 		 140 aa  50.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  26.53 
 
 		 144 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  24.48 
 
 		 145 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  22.07 
 
 		 157 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  25.34 
 
 		 154 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  23.78 
 
 		 145 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 171 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  26.43 
 
 		 158 aa  50.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  24.11 
 
 		 142 aa  50.4  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  25.53 
 
 		 142 aa  50.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  21.94 
 
 		 295 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  36.92 
 
 		 145 aa  49.7  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>