70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1910 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1910  UspA domain protein  100 
 
 		 122 aa  238  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.718457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  57.38 
 
 		 122 aa  143  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1302  UspA domain protein  52.46 
 
 		 122 aa  127  6e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3430  UspA domain protein  50.82 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  47.54 
 
 		 122 aa  114  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  40 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  32.62 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  38.71 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  32.67 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  36 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  30.91 
 
 		 173 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  25.36 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  32.94 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  35.96 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  36.9 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  27.54 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  41.27 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  28.12 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  25.55 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  27.14 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  37.14 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1791  UspA domain-containing protein  29.6 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.933223  normal  0.40622 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  23.88 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  25.4 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  25.76 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  38.1 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  21.32 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  29.29 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  26.09 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  33.8 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  34.69 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  27.41 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  29.87 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  32.63 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  29.2 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  33 
 
 		 295 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  28.93 
 
 		 281 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  27.74 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  27.34 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  31.54 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  30.71 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  35.82 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  38.81 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  27.01 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1612  UspA domain protein  26.19 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  24.31 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  27.08 
 
 		 151 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  27.34 
 
 		 141 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  33.33 
 
 		 157 aa  41.2  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  33.85 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  25.71 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  25.19 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  27.07 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  27.66 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  27.54 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  29.82 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2025  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.99 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.404672  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0542  hypothetical protein  28.57 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.320662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1335  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 149 aa  40.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  25.98 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  28.89 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  28.89 
 
 		 162 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  25.9 
 
 		 145 aa  40  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  26.57 
 
 		 142 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  25.18 
 
 		 164 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>