281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2058 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  100 
 
 		 130 aa  251  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  55.97 
 
 		 133 aa  122  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  53.08 
 
 		 133 aa  118  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  55.3 
 
 		 136 aa  116  9e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  50.78 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  54.96 
 
 		 133 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  46.09 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  59.54 
 
 		 131 aa  102  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  47.24 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  45.31 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  46.09 
 
 		 130 aa  94  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  41.41 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  46.62 
 
 		 138 aa  90.9  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  41.13 
 
 		 129 aa  90.1  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  38.58 
 
 		 130 aa  87.4  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  42.14 
 
 		 136 aa  87  8e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  38.52 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  39.06 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  36.64 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  39.69 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  38.89 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  40.58 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  40.16 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  36.92 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  36.92 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  35.61 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  32.31 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  44.19 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  38.93 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  54.55 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  41.1 
 
 		 162 aa  60.1  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  39.77 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  47.06 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  33.86 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  36.03 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  38.82 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  40.24 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  33.86 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  36.47 
 
 		 221 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  39.33 
 
 		 280 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  35.16 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  26.77 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  46.15 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  32.61 
 
 		 290 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  39.39 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  36.47 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  37.5 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  48.94 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  44.12 
 
 		 133 aa  50.8  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24960  universal stress family protein  37.01 
 
 		 127 aa  50.8  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12342  hypothetical protein  31.39 
 
 		 292 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  29.41 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  38.82 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  36.36 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  32.56 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  34.45 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  28.35 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  29.35 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  42.59 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  47.37 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  33.6 
 
 		 289 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  47.37 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  43.4 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  36.71 
 
 		 316 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  47.37 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  47.37 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  47.37 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  47.37 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  25.2 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  28.28 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  36.67 
 
 		 173 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  50 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  30.6 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  32.59 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  40.74 
 
 		 200 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  35 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  41.18 
 
 		 280 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  36.76 
 
 		 170 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  43.4 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  35 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  32.95 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  39.19 
 
 		 157 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  42.86 
 
 		 173 aa  47.8  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  48.15 
 
 		 156 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  34.38 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  34.38 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  48 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  47.17 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  44.23 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  29.89 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3072  hypothetical protein  42.37 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  44.23 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  35 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4708  hypothetical protein  40.98 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  48.15 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>