130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2387 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  100 
 
 		 129 aa  244  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  52.34 
 
 		 134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  49.22 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  49.22 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  49.22 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  48.84 
 
 		 133 aa  105  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  44.53 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  49.23 
 
 		 133 aa  104  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  49.23 
 
 		 136 aa  103  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  45.31 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  45.31 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  47.69 
 
 		 143 aa  93.6  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  41.09 
 
 		 131 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  47.33 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  42.97 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  39.84 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  44.62 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  44.44 
 
 		 130 aa  84.7  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  54 
 
 		 131 aa  84  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  47.69 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  39.37 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  45.59 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  39.37 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  39.37 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  38.58 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  49.23 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  41.09 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  40.54 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  47.5 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  48.44 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  52.94 
 
 		 221 aa  60.8  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  34.07 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2866  UspA domain-containing protein  39.68 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  45.59 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  43.24 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24960  universal stress family protein  34.65 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  37.18 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  51.52 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  34.38 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  39.29 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  43.48 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19290  universal stress protein UspA-like protein  37.5 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.401097  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  40.79 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  40.74 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  44.12 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  31.85 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  38.24 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  34.74 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  46.15 
 
 		 144 aa  50.8  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  31.76 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  36.36 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  38.03 
 
 		 173 aa  50.8  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  43.24 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  34.62 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  41.82 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  44.44 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4309  hypothetical protein  42.86 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00391503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  44.44 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  44.44 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  47.37 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2441  UspA domain protein  44.23 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186084  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  29.29 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  29.2 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  44.44 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  44.44 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  44.44 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4250  UspA domain-containing protein  45.61 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216245  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  32.05 
 
 		 175 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  38.89 
 
 		 217 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  23.74 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  37.14 
 
 		 296 aa  44.7  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  32.67 
 
 		 278 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  44.44 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  36.56 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3776  UspA domain-containing protein  43.86 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142255  normal  0.186417 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  43.86 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  43.86 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  43.86 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  39.39 
 
 		 280 aa  43.5  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  28.78 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0089  Sodium/hydrogen exchanger  28.21 
 
 		 543 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1650  universal stress protein  43.86 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262714  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4254  UspA domain-containing protein  43.86 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.462473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  32.69 
 
 		 281 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  41.67 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  37.1 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  40.74 
 
 		 294 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4708  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0238  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  38.33 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5901  UspA domain-containing protein  43.86 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.475966  normal  0.0916735 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  38.89 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  33.8 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>