116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4404 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  100 
 
 
161 aa  325  1.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  59.46 
 
 
162 aa  189  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  42 
 
 
154 aa  130  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  43.33 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  42 
 
 
151 aa  118  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  39.88 
 
 
165 aa  115  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  40.82 
 
 
147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  36.73 
 
 
150 aa  107  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  28.19 
 
 
150 aa  67  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  32.17 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  33.1 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1174  UpsA domain-containing protein  31.65 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514178  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  40.26 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  31.4 
 
 
160 aa  59.7  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  31.85 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0044  UspA domain protein  30.56 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.412949  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  37.68 
 
 
125 aa  57.4  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  30.84 
 
 
122 aa  57  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  42.11 
 
 
142 aa  56.6  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  35.53 
 
 
122 aa  55.5  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  45.61 
 
 
142 aa  55.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  36.36 
 
 
133 aa  54.7  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  29.09 
 
 
173 aa  54.7  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3430  UspA domain protein  34.12 
 
 
124 aa  53.9  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  34.21 
 
 
133 aa  53.9  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  39.68 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  44.68 
 
 
136 aa  53.9  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  30.38 
 
 
217 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  35.29 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1302  UspA domain protein  34.12 
 
 
122 aa  52  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  38.71 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4434  UspA domain protein  30.6 
 
 
154 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0155687  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  37.5 
 
 
130 aa  51.6  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  24.66 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4670  hypothetical protein  27.27 
 
 
152 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1910  UspA domain protein  35.96 
 
 
122 aa  51.2  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.718457  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  25.71 
 
 
131 aa  51.2  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  32.47 
 
 
136 aa  50.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  31.93 
 
 
144 aa  50.4  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  42.59 
 
 
221 aa  50.4  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  46 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0832  UspA domain protein  25.56 
 
 
146 aa  50.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  37.68 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  44.68 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  27.34 
 
 
135 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 
130 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  43.9 
 
 
133 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  27.83 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  30.67 
 
 
144 aa  49.3  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  32.98 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  32.63 
 
 
130 aa  48.5  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3893  UspA domain protein  42.31 
 
 
161 aa  48.5  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  32.98 
 
 
130 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  32.98 
 
 
130 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  44.68 
 
 
131 aa  47.8  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  39.06 
 
 
129 aa  47.4  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  42.55 
 
 
130 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  32.89 
 
 
146 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  36.11 
 
 
140 aa  47  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  42.55 
 
 
130 aa  47.4  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4469  hypothetical protein  28.97 
 
 
154 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155394  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  34.25 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  36.76 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3344  UspA domain protein  30.56 
 
 
141 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225845  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  24.83 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  22.76 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  33.85 
 
 
280 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  45.71 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  37.5 
 
 
131 aa  45.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  25 
 
 
151 aa  45.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  21.92 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2441  UspA domain protein  37.74 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186084  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  30.12 
 
 
161 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  33.85 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  27.63 
 
 
141 aa  44.7  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  31.87 
 
 
145 aa  44.3  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  30 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  27.08 
 
 
304 aa  43.9  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  23.81 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5174  hypothetical protein  29.29 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4023  UspA domain-containing protein  26.36 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  25.49 
 
 
293 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  26.96 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  24.46 
 
 
175 aa  43.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  37.04 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  29.47 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  38 
 
 
314 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  32.39 
 
 
149 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  33.33 
 
 
145 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  26.67 
 
 
177 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  34.33 
 
 
142 aa  42.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  38.89 
 
 
116 aa  42.4  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  33.72 
 
 
130 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  42  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  43.59 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  30.26 
 
 
142 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  23.57 
 
 
145 aa  42  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  24.76 
 
 
138 aa  42  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  26.42 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>