187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4101 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  100 
 
 
162 aa  325  2.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  59.46 
 
 
161 aa  189  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  46.98 
 
 
156 aa  130  7.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  44.9 
 
 
154 aa  128  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  39.31 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  37.04 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  40.14 
 
 
151 aa  103  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  37.24 
 
 
147 aa  98.6  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  50 
 
 
150 aa  73.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  36.17 
 
 
122 aa  66.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  34.86 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  40.23 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  33.33 
 
 
173 aa  63.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  53.19 
 
 
136 aa  61.6  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  44.78 
 
 
142 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  40.86 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  30.95 
 
 
135 aa  60.5  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  41.1 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  40.66 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  49.33 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  42.03 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  28.28 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  29.45 
 
 
131 aa  59.7  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  43.94 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1910  UspA domain protein  32.62 
 
 
122 aa  58.5  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.718457  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  39.53 
 
 
130 aa  58.2  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  36.99 
 
 
125 aa  58.2  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  30.77 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  44 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  38.71 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  46.88 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0832  UspA domain protein  30.16 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  34.43 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  39.24 
 
 
221 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0044  UspA domain protein  30.23 
 
 
160 aa  56.6  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.412949  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  51.06 
 
 
133 aa  55.1  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  36 
 
 
133 aa  55.1  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  29.23 
 
 
130 aa  54.3  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  28.68 
 
 
148 aa  54.3  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  36.25 
 
 
131 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3893  UspA domain protein  46.15 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4670  hypothetical protein  28.1 
 
 
152 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  45.1 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  37.84 
 
 
132 aa  52.4  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4469  hypothetical protein  46.15 
 
 
154 aa  52.4  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155394  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.03 
 
 
141 aa  52  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  37.7 
 
 
280 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  27.04 
 
 
304 aa  51.2  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  32.58 
 
 
125 aa  51.2  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  34.67 
 
 
131 aa  51.2  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1174  UpsA domain-containing protein  39.24 
 
 
153 aa  50.8  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514178  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  48.15 
 
 
116 aa  50.8  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  48.15 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  34.48 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  54.29 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  38.46 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  36.78 
 
 
130 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2441  UspA domain protein  43.64 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186084  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  26.06 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5174  hypothetical protein  26.9 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  29.75 
 
 
138 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  35.71 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  44.9 
 
 
314 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  31.46 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  30.25 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  37.33 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  45.28 
 
 
136 aa  48.9  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  34.12 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  35.06 
 
 
131 aa  48.5  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  42.55 
 
 
316 aa  48.5  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  31.76 
 
 
130 aa  48.5  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  40 
 
 
148 aa  48.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  52.08 
 
 
130 aa  48.1  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
130 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3430  UspA domain protein  34.12 
 
 
124 aa  48.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  52.08 
 
 
130 aa  48.1  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0089  Sodium/hydrogen exchanger  25.52 
 
 
543 aa  47.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4434  UspA domain protein  42.31 
 
 
154 aa  47.8  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0155687  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  39.29 
 
 
144 aa  47.8  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  36.07 
 
 
151 aa  47.8  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  30 
 
 
149 aa  47.4  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  40.54 
 
 
140 aa  47.4  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  41.82 
 
 
217 aa  47.4  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  29.66 
 
 
140 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1302  UspA domain protein  28.97 
 
 
122 aa  47  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  26.9 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  30.86 
 
 
154 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2222  UspA domain protein  26.47 
 
 
300 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468875  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3304  UspA domain protein  26.39 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  28.81 
 
 
140 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  28.07 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  28.07 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  28.07 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  29.05 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  33.75 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  28.07 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  28.07 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  27.37 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>