158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4363 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  100 
 
 
150 aa  297  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  48.99 
 
 
144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  41.67 
 
 
146 aa  102  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  43.71 
 
 
142 aa  101  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  37.76 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  40.94 
 
 
160 aa  93.2  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  37.91 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  38.3 
 
 
135 aa  88.2  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  40.85 
 
 
133 aa  84  7e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  40 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  35.42 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  36.62 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  50 
 
 
162 aa  73.6  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  34.62 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  58.49 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  38.03 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  28.19 
 
 
161 aa  67  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  34 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  37.97 
 
 
165 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  33.77 
 
 
154 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  45.71 
 
 
131 aa  60.5  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  49.18 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  46.88 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4434  UspA domain protein  45.45 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0155687  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  42.55 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  37.14 
 
 
132 aa  57.4  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  40.91 
 
 
122 aa  57  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4469  hypothetical protein  46.48 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155394  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3893  UspA domain protein  31.21 
 
 
161 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0832  UspA domain protein  47.06 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  43.55 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  39.39 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1570  UspA domain protein  34.78 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0044  UspA domain protein  42.42 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.412949  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2441  UspA domain protein  45.1 
 
 
152 aa  52  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186084  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  42.03 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  42.86 
 
 
133 aa  50.4  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  41.18 
 
 
150 aa  50.1  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  42.62 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  38.04 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  41.54 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  40.32 
 
 
164 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  44.23 
 
 
133 aa  48.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  28 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  39.71 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  32.82 
 
 
298 aa  47.8  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0089  Sodium/hydrogen exchanger  46.3 
 
 
543 aa  47.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  40 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  40 
 
 
130 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1174  UpsA domain-containing protein  38.46 
 
 
153 aa  47.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514178  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  28.76 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  43.08 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  46.38 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  44.78 
 
 
208 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  27.27 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4818  UspA domain protein  27.89 
 
 
321 aa  46.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1910  UspA domain protein  37.14 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.718457  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  38.57 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  29.05 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  35.21 
 
 
144 aa  45.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1335  UspA domain-containing protein  40.58 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  44.9 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  41.67 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  37.33 
 
 
280 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1300  universal stress protein  37.14 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.116083  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  31.79 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  44.78 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  32.43 
 
 
143 aa  44.3  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4670  hypothetical protein  30 
 
 
152 aa  44.3  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28542  predicted protein  44.64 
 
 
94 aa  44.3  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0189022  hitchhiker  0.0000000559393 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  27.45 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  42.03 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  28.87 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  39.62 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  28.95 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  26.98 
 
 
278 aa  44.3  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1937  hypothetical protein  29.03 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.163086  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2888  UspA domain protein  39.39 
 
 
141 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  37.5 
 
 
147 aa  43.5  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  37.68 
 
 
296 aa  43.5  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  36.76 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  30.11 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  40 
 
 
298 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  26.95 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1409  UspA domain protein  41.43 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.379594  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  28.28 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  32.88 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  36.92 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  38.98 
 
 
300 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  39.62 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  39.68 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  36.76 
 
 
291 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  37.31 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  37.74 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  35.44 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.253274 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>