116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2895 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  100 
 
 
131 aa  266  8.999999999999999e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  48.85 
 
 
135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1570  UspA domain protein  54.69 
 
 
134 aa  128  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  41.73 
 
 
142 aa  105  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  43.65 
 
 
173 aa  102  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  40.29 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  39.33 
 
 
160 aa  94.4  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  34.13 
 
 
133 aa  85.9  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  36.69 
 
 
142 aa  84  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  35.42 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  34.51 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  30.38 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  34.35 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  30.87 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  43.59 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  30.95 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  43.42 
 
 
130 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  50.94 
 
 
142 aa  60.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  29.45 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  38.89 
 
 
151 aa  57.8  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  27.34 
 
 
156 aa  57.4  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  31.86 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0832  UspA domain protein  39.71 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  37.18 
 
 
129 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  35.29 
 
 
133 aa  52.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  39.06 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  30.3 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  36.36 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2441  UspA domain protein  51.02 
 
 
152 aa  52  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186084  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  38.1 
 
 
136 aa  51.6  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  36.99 
 
 
165 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  33.33 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  25.71 
 
 
161 aa  51.2  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  35.63 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  30.39 
 
 
146 aa  50.4  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  35.8 
 
 
133 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  40.38 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  27.78 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  34.07 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  36.23 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  36.23 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  36.23 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  46.03 
 
 
208 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4434  UspA domain protein  42.31 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0155687  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  30.89 
 
 
283 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  31.71 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  40.38 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  36.23 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  35.94 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  33.33 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  28.89 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1302  UspA domain protein  28.81 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1174  UpsA domain-containing protein  31.17 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514178  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  36.99 
 
 
286 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4469  hypothetical protein  45.45 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155394  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  35.14 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  28.37 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  36.49 
 
 
207 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  39.62 
 
 
169 aa  45.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  35.56 
 
 
281 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0044  UspA domain protein  56.76 
 
 
160 aa  45.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.412949  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  30.3 
 
 
125 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  38.18 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3430  UspA domain protein  27.35 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  29.49 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  30 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1910  UspA domain protein  25.4 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.718457  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  33.82 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0418  universal stress protein uspA  41.82 
 
 
297 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5901  UspA domain-containing protein  37.18 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.475966  normal  0.0916735 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  25.87 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  38.89 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  35.53 
 
 
300 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4818  UspA domain protein  29.9 
 
 
321 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  34.62 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  33.33 
 
 
167 aa  43.9  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  25.47 
 
 
306 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  30.85 
 
 
147 aa  42.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  25.71 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1136  UspA domain-containing protein  37.68 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  39.66 
 
 
290 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  30.12 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3893  UspA domain protein  41.86 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  29.87 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  38 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  23.77 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.87 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  38 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1409  UspA domain protein  44.64 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.379594  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  38.6 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  28.38 
 
 
131 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 
148 aa  41.6  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  33.82 
 
 
297 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  23.77 
 
 
145 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 
134 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  30.85 
 
 
156 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6198  UspA domain-containing protein  34.62 
 
 
156 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  29.71 
 
 
139 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4670  hypothetical protein  40.35 
 
 
152 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>