186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4681 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  100 
 
 
142 aa  282  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  43.17 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  37.41 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  65.96 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  48.33 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  35 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  32.89 
 
 
156 aa  60.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  50.94 
 
 
131 aa  60.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  49.33 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  56.9 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  42.22 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  32.87 
 
 
217 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  54.72 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  41.3 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  51.92 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  51.79 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  51.79 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  42.55 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  33.64 
 
 
130 aa  57  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  49.02 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 
134 aa  56.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  45.61 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  28.93 
 
 
169 aa  55.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  31.39 
 
 
154 aa  55.1  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  52.63 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  50.91 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 
161 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  34.51 
 
 
146 aa  53.5  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  35.11 
 
 
130 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1174  UpsA domain-containing protein  31.94 
 
 
153 aa  53.5  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514178  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  47.06 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  30.07 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  31.13 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  44.64 
 
 
165 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  46.15 
 
 
130 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  29.93 
 
 
152 aa  52  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  54.55 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  54.55 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  54.55 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  46.94 
 
 
131 aa  51.2  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  48.98 
 
 
143 aa  50.8  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  48.98 
 
 
136 aa  50.8  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  48 
 
 
173 aa  50.8  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  31.03 
 
 
161 aa  50.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 
144 aa  50.4  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  43.1 
 
 
133 aa  50.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  30.71 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  30 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  38.3 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  32 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4023  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  30.6 
 
 
300 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0832  UspA domain protein  38.98 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  49.02 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  30.94 
 
 
294 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  28.57 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  30.6 
 
 
288 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  30 
 
 
290 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  28.87 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  30.66 
 
 
307 aa  48.9  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  29.29 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  32.09 
 
 
142 aa  48.9  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0044  UspA domain protein  33.33 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.412949  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  46.15 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  50 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  29.41 
 
 
164 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  44.9 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  28.57 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  32.19 
 
 
301 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  29.41 
 
 
164 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  40.38 
 
 
125 aa  47.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  39.22 
 
 
133 aa  47.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2057  UspA domain protein  44 
 
 
137 aa  47.8  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  30.5 
 
 
287 aa  47.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  30.5 
 
 
148 aa  47  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  28.38 
 
 
300 aa  47  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  49.02 
 
 
137 aa  47.4  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  38.78 
 
 
133 aa  47  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  28.89 
 
 
281 aa  47  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  41.51 
 
 
138 aa  47  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  29.93 
 
 
283 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  45.1 
 
 
221 aa  47  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0067  UspA domain protein  30 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0416151  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 
300 aa  45.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  30.66 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  27.81 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  29.58 
 
 
180 aa  45.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1570  UspA domain protein  48.08 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  30.77 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  28.97 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  40.32 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  48.84 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2441  UspA domain protein  25 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>