179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1019 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  100 
 
 		 133 aa  259  6e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  48.46 
 
 		 173 aa  124  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  44.29 
 
 		 142 aa  106  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  42.11 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  43.57 
 
 		 146 aa  98.6  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  39.19 
 
 		 160 aa  89  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  34.13 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  40.85 
 
 		 150 aa  84  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  40.28 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  40.15 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  37.34 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  37.68 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  59.68 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  42.25 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  34.86 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1570  UspA domain protein  37.69 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  36.67 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  44.16 
 
 		 132 aa  60.1  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  42.22 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  36 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  41.79 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  40.45 
 
 		 217 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  42.25 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  45.9 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  34.69 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  37.23 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  40.3 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  41.67 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  36.36 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  43.55 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  36 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  31.11 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  31.11 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4434  UspA domain protein  45.45 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0155687  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  41.77 
 
 		 131 aa  52  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  38.54 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0832  UspA domain protein  43.55 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  42.86 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  36.36 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  47.06 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  26.53 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  43.66 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2441  UspA domain protein  44.23 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186084  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  43.08 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  44.12 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  44.62 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  34.04 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1409  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.23 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.108766  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  33.33 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  39.44 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  28.47 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  28.17 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4309  hypothetical protein  37.68 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00391503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  40.85 
 
 		 286 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  27.33 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  39.39 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  32.85 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  43.66 
 
 		 286 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0070  UspA domain protein  49.02 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  44.23 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  30.5 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  35.71 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  40.98 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  43.04 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  44 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  44 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  44 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  45.31 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1924  UspA domain-containing protein  43.86 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164923 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  43.24 
 
 		 300 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  31.47 
 
 		 287 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1666  hypothetical protein  34.85 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448158  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1174  UpsA domain-containing protein  39.08 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  31.88 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  30.1 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1335  UspA domain-containing protein  41.82 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  28.68 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4469  hypothetical protein  45.83 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155394  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0089  Sodium/hydrogen exchanger  35.48 
 
 		 543 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  46.3 
 
 		 300 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  43.75 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  32.39 
 
 		 289 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  43.75 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  32.64 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  27.66 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  40.3 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4486  hypothetical protein  31.37 
 
 		 306 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  35.64 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  29.08 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  45.28 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0065  UspA domain protein  43.14 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  32.22 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  47.06 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  37.68 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3430  UspA domain protein  38.81 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>