137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3622 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  100 
 
 		 131 aa  259  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  61.24 
 
 		 130 aa  150  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  56.59 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  61.54 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  57.69 
 
 		 133 aa  136  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  53.49 
 
 		 134 aa  118  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  47.69 
 
 		 131 aa  116  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  47.66 
 
 		 131 aa  110  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  50.78 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  49.22 
 
 		 129 aa  103  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  46.83 
 
 		 130 aa  103  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  48.06 
 
 		 130 aa  103  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  43.85 
 
 		 130 aa  103  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  43.85 
 
 		 130 aa  103  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  51.54 
 
 		 133 aa  100  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  45.19 
 
 		 136 aa  100  7e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  42.97 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  46.27 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  45.24 
 
 		 130 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  45.24 
 
 		 130 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  45.24 
 
 		 130 aa  94  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  49.51 
 
 		 131 aa  87  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  43.38 
 
 		 138 aa  84  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  41.98 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  46.51 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  37.4 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  37.88 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  39.85 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24960  universal stress family protein  39.37 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  41.04 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  43.53 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  33.08 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  51.85 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  43.75 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  38.64 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  37.66 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  40.96 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  33.59 
 
 		 165 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  36.36 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  34.67 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  30 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  47.92 
 
 		 173 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.86 
 
 		 299 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 289 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  34.07 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  46.77 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  39.76 
 
 		 280 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3366  UspA domain protein  33.33 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.731635  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  44.68 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  31.94 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  34.85 
 
 		 221 aa  47.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  39.13 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 291 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  35.14 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19290  universal stress protein UspA-like protein  35.94 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.401097  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  42.47 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.62 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 289 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  29.79 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  33.71 
 
 		 320 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  34.83 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  34.83 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  34.83 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  34.83 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  34.83 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  34.83 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  42.11 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  33.85 
 
 		 164 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  38.27 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 293 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  34.43 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  28.87 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  44.9 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  38.27 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0519  hypothetical protein  40.96 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581709  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  32.5 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  41.67 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  34.09 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4679  UspA domain protein  30.22 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2222  UspA domain protein  27.46 
 
 		 300 aa  42.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468875  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  32.94 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  37.63 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  28.68 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  26.39 
 
 		 290 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  32.59 
 
 		 273 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  30.47 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  26.87 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  34.67 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  31.39 
 
 		 154 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  25.74 
 
 		 137 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 144 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  40.74 
 
 		 163 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  40.74 
 
 		 163 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>