14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3366 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3366  UspA domain protein  100 
 
 		 138 aa  257  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.731635  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  33.9 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  35.43 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  38.52 
 
 		 125 aa  48.9  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  33.33 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  35.94 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  42.86 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  36.51 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  38.46 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  39.74 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  32.8 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  45.76 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  31.75 
 
 		 133 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  44.93 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>