168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15870 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  100 
 
 		 136 aa  255  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  62.88 
 
 		 133 aa  151  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  51.94 
 
 		 133 aa  113  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  53.85 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  57.25 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  49.62 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  48.51 
 
 		 136 aa  100  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  49.23 
 
 		 129 aa  98.2  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  51.16 
 
 		 125 aa  97.1  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  46.27 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  44.85 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  41.86 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  44.2 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  44.62 
 
 		 143 aa  88.6  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  39.69 
 
 		 131 aa  84.7  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  44.7 
 
 		 131 aa  84  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  41.86 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  43.41 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  42.64 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  43.41 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  42.64 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  34.35 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  41.04 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  37.4 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  37.4 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  33.85 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  42.71 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  41.86 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  54.93 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  35.66 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  53.19 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  37.93 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  46.88 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  44.93 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24960  universal stress family protein  35.94 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  35.63 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  35.96 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  31.62 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  43.42 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  41.43 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4679  UspA domain protein  34.97 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  45.9 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  46.15 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  44.68 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12342  hypothetical protein  32.43 
 
 		 292 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  39.77 
 
 		 165 aa  52  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  38.1 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  48.98 
 
 		 142 aa  50.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  46.67 
 
 		 142 aa  50.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  53.85 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  34.81 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  41.79 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  47.83 
 
 		 280 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  46.94 
 
 		 221 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  41.86 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  41.86 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  41.86 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  41.86 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  41.86 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  41.86 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  41.86 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  36.47 
 
 		 316 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  40 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  43.55 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  36.36 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  29.93 
 
 		 170 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  29.93 
 
 		 170 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  41.82 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  34.21 
 
 		 290 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  41.18 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  41.18 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  41.18 
 
 		 173 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  35.64 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3366  UspA domain protein  38.46 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.731635  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  33.77 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  29.87 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  29.87 
 
 		 160 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  30.66 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  40.82 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  29.03 
 
 		 301 aa  43.9  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  33.59 
 
 		 305 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  40 
 
 		 280 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2280  universal stress protein UspA-like protein  28.35 
 
 		 277 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00205289  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2222  UspA domain protein  43.4 
 
 		 300 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468875  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  32.35 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1994  universal stress protein UspE  24.26 
 
 		 310 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.91 
 
 		 145 aa  42.7  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  37.25 
 
 		 167 aa  42.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  27.34 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  31.76 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1960  universal stress protein UspE  24.24 
 
 		 310 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2116  universal stress protein UspE  24.24 
 
 		 310 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.673331  normal  0.0394292 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0095  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  43.48 
 
 		 291 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  35.23 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>