More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0738 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  100 
 
 		 143 aa  286  6e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  69.11 
 
 		 125 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  48 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  46.15 
 
 		 129 aa  90.9  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  44.62 
 
 		 136 aa  88.6  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  42.19 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  42.31 
 
 		 137 aa  84.3  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  37.12 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  36.64 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  37.9 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  37.88 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  37.98 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  37.01 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  63.46 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  39.68 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  39.68 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  37.4 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  33.83 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  37.88 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  37.4 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  35.16 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  33.86 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  45.83 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  59.26 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  42.65 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  53.12 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  31.85 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  42.03 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  47.17 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  32.84 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  31.25 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  38.71 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  45.78 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  39.73 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  46.94 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  43.55 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3366  UspA domain protein  33.9 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.731635  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  42.86 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  42.86 
 
 		 165 aa  52.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  40 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  32.23 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  40 
 
 		 160 aa  52  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  42.86 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  42.19 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  38.71 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  35.71 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  46.81 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  46.81 
 
 		 307 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  31.01 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  47.92 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  53.19 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  55.32 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  38.1 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  39.62 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  48.98 
 
 		 142 aa  50.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  55.32 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  44.44 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  53.19 
 
 		 145 aa  50.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  42.59 
 
 		 145 aa  50.1  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  31.25 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  43.64 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  40.74 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  42.62 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  43.4 
 
 		 315 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  43.4 
 
 		 319 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  39.22 
 
 		 173 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  34.71 
 
 		 280 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  43.55 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  43.4 
 
 		 315 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  46.94 
 
 		 221 aa  48.9  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  35.94 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  31.76 
 
 		 304 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  45.28 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  26.81 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  34.13 
 
 		 277 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4679  UspA domain protein  45.07 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  42.11 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  26.36 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3430  UspA domain protein  39.39 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  40.38 
 
 		 296 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  31.67 
 
 		 277 aa  47.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  37.66 
 
 		 290 aa  47.4  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  25.18 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  38.89 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  40.38 
 
 		 300 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  49.02 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  43.64 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.157205 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0923  UspA domain protein  26.32 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.840316  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  43.14 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  43.4 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  41.33 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  26.67 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  30.28 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>