More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1392 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 130 aa  258  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  90 
 
 		 130 aa  233  7e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  62.02 
 
 		 131 aa  150  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  53.08 
 
 		 133 aa  130  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  55.04 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  50.39 
 
 		 132 aa  123  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  51.56 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  46.51 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  48.46 
 
 		 130 aa  116  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  50 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  48.82 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  48.06 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  48.06 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  50 
 
 		 130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  49.21 
 
 		 130 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  42.97 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  50 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  48.84 
 
 		 125 aa  98.6  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  46.09 
 
 		 130 aa  97.4  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  54.62 
 
 		 131 aa  95.9  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  40.62 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  43.38 
 
 		 136 aa  90.5  7e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  42.64 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  41.3 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  37.88 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  35.61 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  39.06 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  38.64 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24960  universal stress family protein  37.01 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  37.12 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  33.86 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  39.69 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  54.55 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  35 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  37.35 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  38.27 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  39.47 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  39.53 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19290  universal stress protein UspA-like protein  36.72 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.401097  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  36.84 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  32.58 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  38.46 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3366  UspA domain protein  36.51 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.731635  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  40.3 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  30.99 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  43.06 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  35.11 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  37.89 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 		 289 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  37.66 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  50 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 172 aa  53.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  38.1 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.37 
 
 		 288 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  41.67 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  43.28 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  47.92 
 
 		 173 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  42.62 
 
 		 145 aa  52  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  25.71 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  43.66 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 161 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  48.94 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  45.45 
 
 		 148 aa  50.4  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  44.83 
 
 		 144 aa  50.4  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.39 
 
 		 299 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 293 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  31.54 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  30 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  23.57 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4679  UspA domain protein  30.6 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  35.53 
 
 		 297 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4309  hypothetical protein  48 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00391503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  26.36 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  33.68 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  29.51 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0065  UspA domain protein  42 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  40.38 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 293 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  41.54 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  40.82 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  44.64 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  41.89 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  48.94 
 
 		 280 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  33.08 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  31.15 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  41.82 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  29.51 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  37.18 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  37.18 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  34.43 
 
 		 291 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  28.43 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>