49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_14340 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  100 
 
 		 141 aa  280  5.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  41.79 
 
 		 136 aa  86.7  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  39.53 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  43.38 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  45.45 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  40.58 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  41.04 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  38.28 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  40.6 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  39.71 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  37.96 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  39.06 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  42.27 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  33.85 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  34.38 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  35.38 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  32.28 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  35.11 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  35.11 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  32.87 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  35.94 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  30.6 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  34.35 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  36.76 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  31.88 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  32.58 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  33.58 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  32.81 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  45.1 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  31.78 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  43.21 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  44.64 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  29.13 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24960  universal stress family protein  32.31 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  40.38 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  27.63 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  32.1 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12342  hypothetical protein  28.99 
 
 		 292 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  30.2 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  36.54 
 
 		 125 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  29.01 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1258  universal stress protein UspA  41.51 
 
 		 320 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  40.74 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  29.85 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  35.19 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 156 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>