81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0905 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  100 
 
 		 130 aa  249  6e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  48 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  48.41 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  41.98 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  38.17 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  37.98 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  36.92 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  37.59 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  40.31 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  37.78 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  34.11 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  34.65 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  34.81 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  33.82 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  38.64 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  36.09 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  36.09 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  31.54 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  35.2 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  35.88 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  35.88 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  35.88 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  31.62 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  35.2 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  31.54 
 
 		 146 aa  52.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  36.67 
 
 		 280 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  31.78 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  33.86 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  31.76 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  41.82 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  31.62 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  43.33 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  43.14 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  47.06 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  42.59 
 
 		 280 aa  45.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  41.51 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  31.79 
 
 		 305 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 296 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 288 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  41.18 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  33.93 
 
 		 296 aa  43.9  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  40 
 
 		 306 aa  43.9  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0528  UspA domain protein  40 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.572687  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  46.94 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  39.34 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0418  universal stress protein uspA  28.57 
 
 		 297 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  37.18 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  28.36 
 
 		 137 aa  42  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  36.71 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  32.06 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  33.83 
 
 		 289 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  36.62 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  34.62 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  36.36 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  33.72 
 
 		 161 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  26.09 
 
 		 142 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  35.09 
 
 		 140 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  36.84 
 
 		 150 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  35.59 
 
 		 156 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  34.92 
 
 		 142 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  46.55 
 
 		 314 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  34.48 
 
 		 157 aa  41.2  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  32.08 
 
 		 145 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  31.45 
 
 		 297 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  33.82 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  35.29 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  37.84 
 
 		 303 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2888  UspA domain protein  37.1 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  32.54 
 
 		 273 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  30.43 
 
 		 288 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  38.16 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0260  universal stress protein  29.49 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  32.41 
 
 		 291 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  36.07 
 
 		 305 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  36 
 
 		 303 aa  40.4  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  34.55 
 
 		 304 aa  40.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  29.61 
 
 		 170 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  29.61 
 
 		 170 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>