147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3071 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  100 
 
 
154 aa  307  2.9999999999999997e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  78.15 
 
 
156 aa  240  3.9999999999999997e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  59.06 
 
 
151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  54.67 
 
 
150 aa  164  4e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  50.67 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  45.45 
 
 
165 aa  135  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  42 
 
 
161 aa  130  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  44.9 
 
 
162 aa  128  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  48.75 
 
 
133 aa  72  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  31.08 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  33.33 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  34 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  42.47 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  34.46 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  41.11 
 
 
131 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  45.83 
 
 
122 aa  61.6  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  33.77 
 
 
150 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  47.83 
 
 
132 aa  60.5  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  32.28 
 
 
135 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  39.44 
 
 
173 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  34.78 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  40.22 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  39.47 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  36.78 
 
 
160 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  51.79 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  42.03 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  39.44 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  38.71 
 
 
122 aa  57.4  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  31.86 
 
 
131 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  40.54 
 
 
131 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  36.36 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  40.96 
 
 
131 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0044  UspA domain protein  33.33 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.412949  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  35.63 
 
 
136 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0832  UspA domain protein  46.03 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  40.79 
 
 
129 aa  55.1  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  43.21 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  41.67 
 
 
133 aa  54.7  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1910  UspA domain protein  32.67 
 
 
122 aa  54.3  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.718457  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2441  UspA domain protein  27.34 
 
 
152 aa  53.9  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186084  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  46.81 
 
 
133 aa  53.9  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  45.1 
 
 
134 aa  53.9  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  37.18 
 
 
130 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  37.18 
 
 
130 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  31.93 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  37.18 
 
 
130 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  29.51 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  37.66 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  32.5 
 
 
138 aa  51.6  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5174  hypothetical protein  36.17 
 
 
147 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3430  UspA domain protein  40 
 
 
124 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  29.7 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  31.62 
 
 
170 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  48.94 
 
 
130 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  46.94 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  48.84 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  42.31 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  32 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1302  UspA domain protein  39.71 
 
 
122 aa  49.7  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1174  UpsA domain-containing protein  28.38 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514178  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  22.97 
 
 
140 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  25.77 
 
 
180 aa  48.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3893  UspA domain protein  47.06 
 
 
161 aa  48.5  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  38.46 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  46.15 
 
 
144 aa  48.5  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  33.33 
 
 
138 aa  48.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  26.35 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 
145 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  21.62 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  21.62 
 
 
140 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  21.62 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  21.62 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  30.49 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  22.83 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  21.62 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  22.3 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  21.62 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  21.62 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  33.58 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  35.38 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  40.43 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  26.53 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  40.43 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  24.48 
 
 
175 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  43.75 
 
 
125 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4434  UspA domain protein  40.62 
 
 
154 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0155687  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  40 
 
 
161 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  26 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  31.25 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  40.38 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4670  hypothetical protein  25.18 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  33.85 
 
 
221 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  37.5 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  31.71 
 
 
145 aa  44.7  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  25.64 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  24.05 
 
 
157 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  27.36 
 
 
316 aa  44.7  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>