67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2423 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  100 
 
 		 130 aa  254  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 130 aa  254  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  66.92 
 
 		 131 aa  178  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  67.44 
 
 		 130 aa  176  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  46.51 
 
 		 130 aa  110  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  43.85 
 
 		 131 aa  103  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  47.69 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  45.45 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  45.31 
 
 		 129 aa  100  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  40.31 
 
 		 132 aa  92.8  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19290  universal stress protein UspA-like protein  45.31 
 
 		 178 aa  89  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.401097  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  42.22 
 
 		 136 aa  88.6  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  41.09 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  41.22 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  40 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  36.84 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  39.53 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  37.21 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  38.89 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  37.4 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  37.78 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  40 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  33.59 
 
 		 137 aa  67  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  46.75 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  36.15 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  36.09 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  39.51 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  31.25 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  28.68 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  41.79 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  56.25 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  34.11 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24960  universal stress family protein  29.13 
 
 		 127 aa  50.8  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  32.87 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  46.81 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 157 aa  48.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  52.08 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  45.83 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  31.01 
 
 		 296 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  42.55 
 
 		 161 aa  47.4  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  45.65 
 
 		 221 aa  47  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  51.22 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  40.43 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  41.67 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0489  hypothetical protein  29.37 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  46 
 
 		 160 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  50 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  29.1 
 
 		 287 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  38.81 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  25 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  29.84 
 
 		 280 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  38 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  54.29 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  37.78 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  39.58 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  26.98 
 
 		 281 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 		 164 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  30.67 
 
 		 299 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0628  universal stress protein G  35 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  53.12 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  30.5 
 
 		 288 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  31.25 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  35.8 
 
 		 304 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  40.91 
 
 		 173 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  29.2 
 
 		 161 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>