169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1530 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  100 
 
 		 133 aa  253  5e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  51.88 
 
 		 133 aa  115  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  53.73 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  47.01 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  59.23 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  47.37 
 
 		 133 aa  103  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  49.24 
 
 		 130 aa  103  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  49.62 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  51.54 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  50.77 
 
 		 125 aa  98.6  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  46.15 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  45.86 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 130 aa  94  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  41.54 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  47.01 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  38.35 
 
 		 137 aa  87.8  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  44.62 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  41.86 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  40 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  44.7 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  41.22 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  41.22 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  40.46 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  45.45 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  41.18 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  44.62 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  37.4 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  43.37 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  56.6 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  34.78 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  43.42 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  45.28 
 
 		 217 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  35.88 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  34.04 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  36 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  30.22 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  51.11 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  36.78 
 
 		 221 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  35.29 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24960  universal stress family protein  34.11 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  48.08 
 
 		 280 aa  51.6  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  33.82 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  36.54 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  34.09 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  43.9 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  33.33 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4679  UspA domain protein  34.78 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  37.08 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  31.75 
 
 		 280 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  38.46 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  39.09 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  39.09 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  39.09 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  39.09 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  39.09 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  39.09 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  34.26 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  39.22 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  38.18 
 
 		 164 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  39.78 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  42 
 
 		 173 aa  47  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  41.51 
 
 		 159 aa  47  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  28.87 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1258  universal stress protein UspA  29.82 
 
 		 320 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.89 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  37.25 
 
 		 316 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  42 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  40.74 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  31.78 
 
 		 162 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  42.25 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  37.5 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  36.54 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  35.44 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  39.22 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  43.75 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  43.4 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.99 
 
 		 304 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  30.95 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  30.34 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  42.31 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  40.74 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  40.74 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  40.74 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  33.33 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  31.4 
 
 		 144 aa  43.5  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  42.31 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  33.72 
 
 		 172 aa  43.5  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  34.26 
 
 		 144 aa  42.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3366  UspA domain protein  39.74 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.731635  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  32.18 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  34.25 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>