84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3006 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  100 
 
 		 142 aa  276  6e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  44.93 
 
 		 135 aa  110  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  44.29 
 
 		 133 aa  106  9.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  41.73 
 
 		 131 aa  105  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  37.96 
 
 		 173 aa  98.6  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  45.7 
 
 		 160 aa  97.8  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1570  UspA domain protein  46.15 
 
 		 134 aa  94  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  40.28 
 
 		 144 aa  90.5  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  41.38 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  40.25 
 
 		 221 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  38.3 
 
 		 146 aa  84  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  40 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  38.41 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  58.93 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  46.05 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  32.17 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  40.66 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  53.12 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  40.22 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  41.3 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  34 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  33.58 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  44 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0832  UspA domain protein  45.16 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  40.66 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  40.28 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  36.9 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  44.93 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  44.93 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  32.23 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  38.71 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  35.29 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0044  UspA domain protein  54.17 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.412949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  40.91 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  46.67 
 
 		 136 aa  50.8  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  40.91 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  40.91 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  41.56 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4434  UspA domain protein  43.86 
 
 		 154 aa  50.1  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0155687  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  40.28 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1174  UpsA domain-containing protein  53.06 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  49.06 
 
 		 125 aa  48.9  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  44 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  41.89 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  44.44 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  39.13 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  40.32 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  26.71 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  37.23 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2441  UspA domain protein  48.98 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186084  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4469  hypothetical protein  41.67 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155394  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  27.14 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  42.31 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  39.47 
 
 		 415 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  44.07 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  30.26 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4670  hypothetical protein  44.44 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  30.07 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  28.17 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3893  UspA domain protein  31.82 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  43.94 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3154  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.759591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  32.14 
 
 		 131 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  41.67 
 
 		 167 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0067  UspA domain protein  29.63 
 
 		 126 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0416151  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  28.28 
 
 		 208 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  30.57 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  34.85 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  29.29 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  27.14 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  25.16 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  53.12 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  39.73 
 
 		 283 aa  41.2  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  53.12 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  36.71 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  30.66 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  30.85 
 
 		 156 aa  40.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 142 aa  40  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>