145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3007 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 130 aa  258  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  87.4 
 
 		 131 aa  225  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  67.72 
 
 		 130 aa  180  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  67.72 
 
 		 130 aa  178  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  67.72 
 
 		 130 aa  178  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  49.21 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  46.83 
 
 		 131 aa  103  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  48.82 
 
 		 130 aa  100  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  43.75 
 
 		 133 aa  98.6  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  44.09 
 
 		 132 aa  94.4  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  42.06 
 
 		 131 aa  88.2  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  42.06 
 
 		 125 aa  87  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  44.44 
 
 		 130 aa  87  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  39.68 
 
 		 134 aa  86.7  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  40.31 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  41.09 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  41.09 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  38.28 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  39.86 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  41.86 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  39.37 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  38.81 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  39.06 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  32.81 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  48.1 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  48.72 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  43.42 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4679  UspA domain protein  32.61 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  47.17 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  42.5 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  42.42 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  40.28 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  47.06 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  42 
 
 		 221 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  31.78 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  43.33 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.56 
 
 		 299 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  34.65 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  43.08 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  41.51 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  40.85 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  42.31 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  35.71 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1372  UspA domain-containing protein  53.06 
 
 		 283 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.478759  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24960  universal stress family protein  31.2 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  37.14 
 
 		 173 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  26.76 
 
 		 217 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  33.77 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  36.36 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  24.63 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  25.38 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  35.34 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  36.76 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  38.46 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4309  hypothetical protein  34.72 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00391503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  39.22 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  42.31 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  37.66 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  35.71 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  30.77 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  26.02 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 290 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  32.85 
 
 		 285 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  31.11 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  29.41 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  41.18 
 
 		 287 aa  46.2  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  36.14 
 
 		 316 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  25.6 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  33.96 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  32.39 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 293 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  45.28 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  36.36 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  36.78 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  43.75 
 
 		 415 aa  44.3  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  38.89 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  29.77 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  36.9 
 
 		 156 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  37.5 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  37.5 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1650  universal stress protein  30.28 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262714  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  37.5 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  37.5 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  37.5 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  37.5 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  31.16 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  33.96 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  30 
 
 		 169 aa  42.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  29.58 
 
 		 317 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  34.62 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0155  hypothetical protein  30.71 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  33.33 
 
 		 293 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  41.18 
 
 		 300 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 293 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  31.16 
 
 		 305 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  45 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 293 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  27.74 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>