108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4351 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  100 
 
 
147 aa  295  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  50.67 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  50.67 
 
 
156 aa  143  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  41.89 
 
 
151 aa  120  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  42.86 
 
 
150 aa  114  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  40.82 
 
 
161 aa  108  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  37.24 
 
 
162 aa  98.6  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  33.54 
 
 
165 aa  84  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  49.28 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  38.75 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  37.5 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  38.74 
 
 
142 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  40.43 
 
 
131 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  42.25 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  45.78 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  52.63 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  29.32 
 
 
148 aa  53.5  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  36.47 
 
 
130 aa  52  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  34.38 
 
 
173 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  38.71 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  43.48 
 
 
133 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  44.12 
 
 
144 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  63.16 
 
 
131 aa  50.8  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  35.63 
 
 
131 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  42.03 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  53.85 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  35.14 
 
 
151 aa  50.1  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  43.75 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  43.75 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  43.75 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  53.85 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  41.43 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  33.62 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  33.62 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  37.08 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  41.18 
 
 
142 aa  48.9  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  36.49 
 
 
160 aa  48.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  34.07 
 
 
131 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  43.08 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  40.58 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  43.94 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.16 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  36.76 
 
 
309 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  47.06 
 
 
138 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  51.22 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  51.22 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  37.66 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  40.35 
 
 
290 aa  45.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  24.29 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  50 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2049  UspA domain-containing protein  45.83 
 
 
289 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  41.18 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  30 
 
 
287 aa  45.1  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  40.43 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1174  UpsA domain-containing protein  30 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514178  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  25.93 
 
 
145 aa  44.3  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  39.13 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  47.5 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 
145 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  39.51 
 
 
221 aa  43.9  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  54.05 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 
145 aa  42.7  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  34.67 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  33.33 
 
 
292 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1088  UspA domain-containing protein  43.14 
 
 
295 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103411  normal  0.107054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  44.19 
 
 
293 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  45.24 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  45 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2076  UspA domain protein  38.81 
 
 
288 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000523468 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  39.06 
 
 
304 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  41.94 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  44.44 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  44.83 
 
 
153 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  47.5 
 
 
316 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1072  hypothetical protein  43.14 
 
 
316 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  41.67 
 
 
276 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  27.45 
 
 
170 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  35.59 
 
 
192 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  31.01 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  44.23 
 
 
148 aa  41.2  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  44.83 
 
 
153 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  44.83 
 
 
153 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  30.99 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  33.8 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5077  UspA domain protein  38.16 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.903375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  34.25 
 
 
291 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  25.93 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  33.85 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0044  UspA domain protein  41.07 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.412949  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  37.5 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  26.5 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  29.29 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  30 
 
 
217 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  34.38 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3430  UspA domain protein  41.27 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4670  hypothetical protein  35.56 
 
 
152 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  22.86 
 
 
145 aa  40.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  27.41 
 
 
145 aa  40.4  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3370  hypothetical protein  26.62 
 
 
292 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>