285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0221 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  100 
 
 
122 aa  236  8e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1910  UspA domain protein  57.38 
 
 
122 aa  143  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.718457  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  58.2 
 
 
122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3430  UspA domain protein  55.74 
 
 
124 aa  121  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1302  UspA domain protein  51.64 
 
 
122 aa  117  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  33.09 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  33.82 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  36 
 
 
133 aa  58.9  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  41.56 
 
 
173 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  38.71 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  30.37 
 
 
138 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  36.05 
 
 
146 aa  57  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  29.85 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  27.74 
 
 
145 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  30.77 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 
143 aa  56.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  35.53 
 
 
161 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  27.74 
 
 
148 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  37.93 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  33.06 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  27.54 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  27.54 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  30.83 
 
 
291 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  33.57 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  33.57 
 
 
156 aa  54.3  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  27.01 
 
 
145 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  29.84 
 
 
128 aa  53.9  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  33.81 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  27.74 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  27.54 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  29.41 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  29.41 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
140 aa  52.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  31.45 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  36.25 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3808  UspA domain protein  32.21 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  36.59 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  30.77 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  37.35 
 
 
165 aa  52  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  29.23 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  32.86 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  32.53 
 
 
164 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  30 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  42.47 
 
 
133 aa  51.2  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  30.15 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  25.55 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  31.71 
 
 
324 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  40.51 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  34.62 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  30.71 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  26.32 
 
 
138 aa  50.8  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  33.86 
 
 
130 aa  50.4  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  38.78 
 
 
131 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  29.01 
 
 
297 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  33.8 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  32.95 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  27.78 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  27.5 
 
 
515 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  40 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  32.12 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  26.39 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  27.34 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  35.94 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  40 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  38.46 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  33.77 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  35 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  33.33 
 
 
133 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  39.71 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  31.03 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  36.51 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  29.41 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  42.03 
 
 
280 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  32.74 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  32.41 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  36.9 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2888  UspA domain protein  28.78 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  29.01 
 
 
297 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  31.11 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  39.73 
 
 
140 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4576  UspA domain-containing protein  29.27 
 
 
276 aa  47.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000479779 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  41.82 
 
 
139 aa  47.8  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  27.74 
 
 
317 aa  47.4  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  29.32 
 
 
138 aa  47.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  27.94 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  36.71 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0542  hypothetical protein  25.87 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.320662  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  30.77 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  29.2 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  32.12 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  30.77 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  24.17 
 
 
278 aa  47  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  38.37 
 
 
158 aa  47  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  27.01 
 
 
141 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  35.38 
 
 
154 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  25.37 
 
 
750 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  30.99 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0528  UspA domain protein  26.76 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.572687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>