164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1913 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  100 
 
 		 131 aa  244  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  59.69 
 
 		 133 aa  134  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  57.25 
 
 		 136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  53.08 
 
 		 130 aa  124  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  56.62 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  59.23 
 
 		 133 aa  120  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  54.2 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  51.47 
 
 		 133 aa  114  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  54.62 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  48.15 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  51.18 
 
 		 125 aa  107  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  52.71 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  44.27 
 
 		 131 aa  100  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  49.22 
 
 		 131 aa  100  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  46.56 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  46.03 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  38.58 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  48.82 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  48.82 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  48.46 
 
 		 132 aa  92.8  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  48.03 
 
 		 130 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  44.19 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  43.51 
 
 		 130 aa  87  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  41.54 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  41.54 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  45.93 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  33.59 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  43.41 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  40.23 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  41.09 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  54.55 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  35.16 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  41.11 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  38.64 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  42.67 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  37.01 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24960  universal stress family protein  37.01 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  43.94 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  40.43 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  35.61 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  36.26 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  34.92 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  42.11 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  37.33 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  43.66 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19290  universal stress protein UspA-like protein  39.06 
 
 		 178 aa  51.6  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.401097  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  41.67 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  44.44 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  41.89 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  34.62 
 
 		 221 aa  50.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3366  UspA domain protein  37.9 
 
 		 138 aa  50.1  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.731635  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  44.68 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  44 
 
 		 217 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  36.23 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  33.01 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  42.65 
 
 		 294 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  33.33 
 
 		 160 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  36.69 
 
 		 280 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0044  UspA domain protein  40.35 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.412949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  54.9 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1910  UspA domain protein  30.95 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.718457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12342  hypothetical protein  30.66 
 
 		 292 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  43.14 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  37.31 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1172  UspA domain protein  32.11 
 
 		 274 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  39.62 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1583  UspA domain-containing protein  34.13 
 
 		 274 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.932581  normal  0.58518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  40.48 
 
 		 173 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  32.1 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  35.21 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  33.75 
 
 		 173 aa  44.3  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  31.9 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  34.62 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  36.36 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  28.06 
 
 		 288 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  32.32 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4679  UspA domain protein  30.94 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  38.33 
 
 		 143 aa  43.5  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  36.92 
 
 		 300 aa  43.5  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  45.28 
 
 		 163 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  36.14 
 
 		 300 aa  43.5  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.33 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0709  UspA domain protein  31.43 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  34.21 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  35.38 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  41.18 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  32.5 
 
 		 283 aa  42.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  39.68 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  45.28 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  30 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  30 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  31.73 
 
 		 297 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4708  hypothetical protein  35.94 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  47.37 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  47.37 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  47.37 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  27.94 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>