84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2484 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  100 
 
 		 146 aa  294  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  36.36 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  39.85 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  41.18 
 
 		 133 aa  73.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  37.68 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  44.74 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  34.59 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  35.38 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  44.93 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  34.07 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  34.81 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  53.85 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  55.77 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  42.11 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  31.82 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  29.23 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  30.94 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  31.54 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  48.08 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  33.58 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  31.54 
 
 		 130 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 130 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  46.3 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  30.39 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  39.06 
 
 		 221 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  36.99 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  32 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  35.06 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  41.67 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  28.99 
 
 		 130 aa  49.7  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  38.03 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5174  hypothetical protein  37.08 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  32.89 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  42.19 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  29.17 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  34.41 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  30.1 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  41.67 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  41.67 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  39.39 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  33.33 
 
 		 217 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  29.73 
 
 		 162 aa  44.3  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  32.29 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  39.13 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  32.29 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  32.29 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  32.29 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  32.29 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0542  hypothetical protein  24.34 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.320662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  32.29 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.88 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0519  hypothetical protein  32.84 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581709  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  46.15 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  34.92 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  32.29 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  25.78 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  41.18 
 
 		 307 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  35.06 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.88 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  29.9 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  29.41 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 		 145 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  37.25 
 
 		 170 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  31.88 
 
 		 165 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  37.5 
 
 		 282 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  27.78 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  30.38 
 
 		 288 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 167 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  35.06 
 
 		 305 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  34.67 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.49 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.62 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  33.33 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  29.73 
 
 		 175 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  38.46 
 
 		 304 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  21.93 
 
 		 156 aa  40.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  29.58 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24960  universal stress family protein  40.38 
 
 		 127 aa  40.4  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  24.75 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  30.77 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4244  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 144 aa  40  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>