37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_24960 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_24960  universal stress family protein  100 
 
 		 127 aa  244  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  39.37 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  34.65 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  33.86 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  33.86 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  37.01 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  34.65 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  35.43 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  34.65 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  35.94 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  35.43 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  34.11 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  29.13 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  29.13 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  32.56 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  31.2 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  29.13 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  37.01 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  32.33 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  35.29 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  32.8 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  33.07 
 
 		 143 aa  50.8  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  32 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  32 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  35.07 
 
 		 288 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  41.27 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  30.37 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  32.31 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  31.78 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  34.65 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  27.56 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  32.2 
 
 		 280 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  32.09 
 
 		 289 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12342  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  31.34 
 
 		 297 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  28.06 
 
 		 302 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  40.38 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>