133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0356 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  100 
 
 
134 aa  266  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  53.49 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  53.49 
 
 
131 aa  123  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  52.34 
 
 
129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  55.04 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  44.19 
 
 
132 aa  103  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  45.8 
 
 
133 aa  100  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  42.31 
 
 
131 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  39.68 
 
 
130 aa  92  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  39.06 
 
 
133 aa  88.2  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  42.64 
 
 
136 aa  88.2  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  42.75 
 
 
130 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  42.75 
 
 
130 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  39.69 
 
 
131 aa  85.9  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  44.7 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  40 
 
 
130 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  39.53 
 
 
130 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  39.53 
 
 
130 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  40.31 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  39.26 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  46.56 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  39.69 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  37.98 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  38.46 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  30.37 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  34.81 
 
 
130 aa  63.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24960  universal stress family protein  34.65 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  32.85 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  34.81 
 
 
146 aa  60.5  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  34.85 
 
 
141 aa  57  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  30.23 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  52.83 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  44.44 
 
 
116 aa  56.2  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  53.06 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  39.76 
 
 
173 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19290  universal stress protein UspA-like protein  34.38 
 
 
178 aa  51.2  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.401097  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  39.29 
 
 
164 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  39.29 
 
 
164 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  39.29 
 
 
164 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  40 
 
 
201 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  39.29 
 
 
164 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  39.29 
 
 
164 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  39.29 
 
 
164 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  40 
 
 
201 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  40 
 
 
191 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  41.25 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4679  UspA domain protein  31.65 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  40 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  34.62 
 
 
221 aa  49.7  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  39.02 
 
 
164 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  40 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  40 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  40 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  36.46 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.91 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  33.1 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  34.45 
 
 
283 aa  47.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  37.5 
 
 
157 aa  47  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4254  UspA domain-containing protein  43.86 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.462473  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  35.23 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1650  universal stress protein  43.64 
 
 
156 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262714  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3776  UspA domain-containing protein  43.86 
 
 
157 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142255  normal  0.186417 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  38.27 
 
 
300 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  44.44 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  36.11 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  28.28 
 
 
154 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  35.44 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4250  UspA domain-containing protein  42.11 
 
 
157 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216245  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  45.1 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  41.67 
 
 
160 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  35.71 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  38.55 
 
 
155 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  41.67 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  35.71 
 
 
300 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  37.04 
 
 
167 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  28.87 
 
 
143 aa  44.7  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  37.04 
 
 
167 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  36.71 
 
 
325 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  40.38 
 
 
156 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  28.1 
 
 
157 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  36.71 
 
 
163 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  33.59 
 
 
415 aa  43.9  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  40.82 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2734  UspA domain protein  35.8 
 
 
319 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  36.21 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  32.89 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  32.89 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  40.82 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  34.78 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  35.29 
 
 
296 aa  42.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  29.25 
 
 
207 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  27.91 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  34.15 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  31.71 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1391  universal stress protein, UspA  48.94 
 
 
327 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5901  UspA domain-containing protein  43.4 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.475966  normal  0.0916735 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>