187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3499 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 131 aa  261  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  87.4 
 
 		 130 aa  225  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  68.99 
 
 		 130 aa  184  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  68.99 
 
 		 130 aa  183  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  68.99 
 
 		 130 aa  183  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  51.56 
 
 		 130 aa  126  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  47.66 
 
 		 131 aa  110  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  51.56 
 
 		 130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  45.38 
 
 		 133 aa  105  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  47.66 
 
 		 132 aa  104  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  45.86 
 
 		 133 aa  94.4  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  44.53 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  42.31 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  42.97 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  41.09 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  41.09 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  41.41 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  43.75 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  44.7 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  41.22 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  41.22 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  34.59 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  40.3 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  53.16 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  38.52 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  48.72 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  43.59 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  33.86 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  37.78 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  34.65 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  42.17 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  36.78 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4679  UspA domain protein  32.12 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24960  universal stress family protein  35.43 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  38.54 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  49.02 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  43.21 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  36.25 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  32.58 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  47.06 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  38.64 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  35.94 
 
 		 141 aa  52.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  29.23 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  39.44 
 
 		 142 aa  52  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  29.79 
 
 		 217 aa  51.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  35.82 
 
 		 296 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  35.8 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  44.62 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  38.67 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  35.21 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  36.84 
 
 		 287 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1372  UspA domain-containing protein  53.06 
 
 		 283 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.478759  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  34.43 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  38.55 
 
 		 415 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  27.2 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  42.42 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  26.12 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  36.09 
 
 		 297 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  31.54 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  38.37 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  41.51 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  37.41 
 
 		 285 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  43.14 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  29.58 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  46.15 
 
 		 316 aa  47  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  28.46 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  37.14 
 
 		 173 aa  47  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  30.6 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  43.64 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  35.37 
 
 		 281 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  34.18 
 
 		 278 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  39.29 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  41.82 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.43 
 
 		 299 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  29.69 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  38.46 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  30.88 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  44.44 
 
 		 300 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  34.62 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 297 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  34.04 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  36.36 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  32.14 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  32.73 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  31.91 
 
 		 292 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 292 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  39.62 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4309  hypothetical protein  36.07 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00391503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  32.5 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 292 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 289 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  36 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 		 297 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  38.46 
 
 		 191 aa  43.5  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  39.68 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  38.46 
 
 		 201 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  45.28 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  38.46 
 
 		 201 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>