134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2519 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  100 
 
 
150 aa  298  1e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  54.67 
 
 
154 aa  164  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  54.67 
 
 
156 aa  159  9e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  47.97 
 
 
151 aa  140  7e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  42.86 
 
 
147 aa  114  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  39.31 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  36.73 
 
 
161 aa  107  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  33.72 
 
 
165 aa  97.8  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  44.19 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2441  UspA domain protein  32.14 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186084  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  48.33 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4469  hypothetical protein  32.47 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155394  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  35.94 
 
 
135 aa  63.5  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  33.86 
 
 
130 aa  62.8  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  36.67 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  46.05 
 
 
142 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  38.89 
 
 
173 aa  60.5  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  35.11 
 
 
130 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0832  UspA domain protein  46.15 
 
 
146 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  44 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  43.33 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  30.08 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  37.66 
 
 
131 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  35.96 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  40.24 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  40 
 
 
122 aa  55.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3893  UspA domain protein  31.54 
 
 
161 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  37.93 
 
 
122 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  44.68 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  42.25 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  47.83 
 
 
134 aa  54.3  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1910  UspA domain protein  36 
 
 
122 aa  53.9  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.718457  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  41.1 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  35.11 
 
 
130 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  35.11 
 
 
130 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  35.11 
 
 
130 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4670  hypothetical protein  29.5 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  51.11 
 
 
133 aa  52.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0044  UspA domain protein  36.07 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.412949  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1174  UpsA domain-containing protein  29.58 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514178  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  34.78 
 
 
160 aa  51.6  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  37.33 
 
 
131 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  47.92 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  47.37 
 
 
144 aa  51.2  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  33.33 
 
 
131 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  54.29 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  41.18 
 
 
150 aa  50.1  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  39.24 
 
 
221 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  39.34 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  42.59 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4309  hypothetical protein  33.77 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00391503  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  37.31 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  42.86 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  30.53 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4434  UspA domain protein  29.23 
 
 
154 aa  47  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0155687  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  48 
 
 
158 aa  47  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  23.87 
 
 
157 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  50 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3430  UspA domain protein  34.18 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  42.59 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  22.08 
 
 
154 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1570  UspA domain protein  29.58 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  40.74 
 
 
148 aa  46.2  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3072  hypothetical protein  39.47 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  32.98 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  37.04 
 
 
142 aa  45.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  38.1 
 
 
217 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  42 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  26.75 
 
 
175 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  31.17 
 
 
289 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2796  hypothetical protein  28.28 
 
 
302 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  40.79 
 
 
140 aa  44.3  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  38.1 
 
 
316 aa  44.3  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  39.62 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0617  serine/threonine protein kinase protein  29.33 
 
 
469 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1302  UspA domain protein  32.91 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  27.52 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  36 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  50 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  50 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  25.62 
 
 
180 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5077  UspA domain protein  27.48 
 
 
156 aa  43.5  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.903375 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  40 
 
 
143 aa  43.5  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  37.1 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  27.74 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  31.08 
 
 
140 aa  42.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  29.7 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  29.32 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  37.04 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  23.02 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  32.1 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  28.7 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  28.19 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  39.62 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  23.31 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  28.19 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>