167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3629 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  100 
 
 
146 aa  288  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  45.33 
 
 
160 aa  120  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  41.67 
 
 
150 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  39.35 
 
 
221 aa  101  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  38.93 
 
 
173 aa  100  9e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  43.57 
 
 
133 aa  98.6  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  39.04 
 
 
144 aa  93.6  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  38.57 
 
 
135 aa  87.4  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  37.24 
 
 
142 aa  87.4  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  38.3 
 
 
142 aa  84  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  36.73 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  34.51 
 
 
131 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  31.25 
 
 
148 aa  77  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  62.26 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  44.19 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1570  UspA domain protein  33.1 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  31.08 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  44 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  46.67 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  34.88 
 
 
122 aa  60.5  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  53.12 
 
 
143 aa  60.5  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  28.28 
 
 
162 aa  59.3  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1910  UspA domain protein  40 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.718457  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  37.37 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  30.92 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  31.85 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  31.21 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  26.09 
 
 
141 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  36.05 
 
 
122 aa  57  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  29.87 
 
 
295 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  34.51 
 
 
142 aa  53.5  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  43.04 
 
 
125 aa  53.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  43.84 
 
 
280 aa  52.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  49.06 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  40.7 
 
 
145 aa  52.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0832  UspA domain protein  45.45 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 
156 aa  52  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  47.92 
 
 
130 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  43.08 
 
 
129 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  48.94 
 
 
130 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  43.86 
 
 
157 aa  50.1  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  34.88 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  36.26 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  33.62 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  41.03 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  29.25 
 
 
297 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  41.03 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3430  UspA domain protein  40.3 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  36.59 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  34.88 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  50 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1302  UspA domain protein  39.02 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  35.16 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  37.84 
 
 
137 aa  47.8  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4434  UspA domain protein  46.15 
 
 
154 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0155687  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  41.18 
 
 
116 aa  47.8  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3304  UspA domain protein  26.24 
 
 
144 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  37.78 
 
 
131 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  34.82 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  42.47 
 
 
130 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  30.38 
 
 
154 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3893  UspA domain protein  43.48 
 
 
161 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0089  Sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
543 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2441  UspA domain protein  41.18 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186084  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  43.55 
 
 
136 aa  46.2  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  38.24 
 
 
172 aa  47  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  33.33 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  39.39 
 
 
146 aa  45.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  45.1 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  30.34 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1335  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  41.94 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  30.59 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  25.52 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  45.1 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  44 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  29.89 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  46.94 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  37.93 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  26.21 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  34.88 
 
 
300 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  29.08 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  33.04 
 
 
156 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  37.88 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  39.71 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  28.95 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  34.78 
 
 
750 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  34.72 
 
 
296 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  41.51 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0044  UspA domain protein  38.98 
 
 
160 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.412949  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  39.74 
 
 
280 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  34.25 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  29.27 
 
 
212 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  30 
 
 
303 aa  42.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4469  hypothetical protein  43.9 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155394  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  34.38 
 
 
286 aa  42.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>