114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2624 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  100 
 
 
160 aa  308  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  63.23 
 
 
221 aa  185  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  45.33 
 
 
146 aa  120  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  45.7 
 
 
142 aa  97.8  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  39.33 
 
 
131 aa  94.4  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  38.96 
 
 
144 aa  94.4  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  40.94 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  36.94 
 
 
173 aa  90.9  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  39.6 
 
 
142 aa  89  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  39.19 
 
 
133 aa  89  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  31.82 
 
 
148 aa  84.3  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  34.46 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  35.48 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  50.77 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1570  UspA domain protein  36.18 
 
 
134 aa  61.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  31.4 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  43.94 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  36.78 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  41.03 
 
 
165 aa  57.8  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  38.67 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  41.18 
 
 
122 aa  56.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  42.86 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 
130 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  37.18 
 
 
130 aa  53.9  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  36.67 
 
 
287 aa  53.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0832  UspA domain protein  43.55 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  39.13 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  40 
 
 
143 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  43.84 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  41.43 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  34.78 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  26 
 
 
141 aa  51.2  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  38.46 
 
 
129 aa  51.2  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  42.47 
 
 
130 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  42.47 
 
 
130 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  29.14 
 
 
142 aa  50.8  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  38.67 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  46.3 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
130 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5174  hypothetical protein  37.66 
 
 
147 aa  48.5  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  36.49 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  43.24 
 
 
125 aa  48.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0519  hypothetical protein  36.62 
 
 
145 aa  47.4  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  37.8 
 
 
314 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  33.33 
 
 
131 aa  47  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1174  UpsA domain-containing protein  52.17 
 
 
153 aa  47  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514178  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  28.48 
 
 
145 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  29.03 
 
 
295 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  30.97 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  36.36 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  33.8 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  36.71 
 
 
300 aa  45.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  36.92 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  31.29 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  29.61 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  29.11 
 
 
145 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  41.67 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  48.94 
 
 
116 aa  44.7  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4434  UspA domain protein  39.74 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0155687  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  38.64 
 
 
283 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  33.9 
 
 
158 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2441  UspA domain protein  43.14 
 
 
152 aa  44.3  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186084  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  46 
 
 
130 aa  43.9  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  46 
 
 
130 aa  43.9  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  28.57 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0089  Sodium/hydrogen exchanger  42.62 
 
 
543 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3607  hypothetical protein  27.87 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  37.74 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  37.74 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5901  UspA domain-containing protein  36.92 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.475966  normal  0.0916735 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  37.74 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  40.74 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  31.51 
 
 
144 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  29.8 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2888  UspA domain protein  30.72 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  53.49 
 
 
142 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  28.57 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  38.81 
 
 
207 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  30.87 
 
 
294 aa  43.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  26.58 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  31.17 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  27.7 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6198  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  37.66 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4670  hypothetical protein  40 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1165  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  26.92 
 
 
145 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  25.66 
 
 
142 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  45.45 
 
 
169 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2543  UspA domain protein  36.46 
 
 
141 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  42.86 
 
 
136 aa  42  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  30.77 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  32.69 
 
 
150 aa  41.6  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  27.45 
 
 
169 aa  41.6  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  41.89 
 
 
140 aa  41.6  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  32.53 
 
 
134 aa  41.2  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  34.43 
 
 
152 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  30.07 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  34.43 
 
 
152 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>