More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1165 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1165  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  296  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5174  hypothetical protein  67.38 
 
 		 147 aa  197  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0458  hypothetical protein  60 
 
 		 144 aa  180  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0519  hypothetical protein  59.03 
 
 		 145 aa  179  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581709  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3304  UspA domain protein  58.04 
 
 		 144 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3628  UspA domain protein  58.04 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  34.27 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  30.5 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  31.91 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2543  UspA domain protein  34.51 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  31.94 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  30.5 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1741  hypothetical protein  34.53 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.447862  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  33.57 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4309  hypothetical protein  33.81 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00391503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  28.78 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  28.57 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1627  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  32.87 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0134  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0818403 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  32.17 
 
 		 280 aa  57.4  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  30.56 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 167 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  27.14 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  27.86 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0944  UspA domain-containing protein  26.62 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  33.57 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  28.87 
 
 		 291 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0913  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  37.08 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  29.73 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  39.24 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  29.87 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  29.05 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  32.89 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  36.71 
 
 		 280 aa  53.5  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  31.72 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  26.76 
 
 		 284 aa  52.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  30.82 
 
 		 300 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.67 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  28.87 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  26.72 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  26.76 
 
 		 288 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  30.67 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3700  hypothetical protein  29.67 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  40.85 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  47.17 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1924  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164923 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  28.57 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  27.97 
 
 		 295 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  28.28 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  51.02 
 
 		 167 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  28.48 
 
 		 310 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  30.97 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  30 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  33.1 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  33.1 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  33.33 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  32.87 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  45.45 
 
 		 323 aa  50.8  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  32.39 
 
 		 289 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  46.67 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  29.58 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  30.61 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  49.06 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  26.32 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1559  UspA domain protein  30.61 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.411505 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  28.97 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  31.65 
 
 		 297 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  49.06 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  28.48 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1014  UspA domain protein  35.05 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  34.48 
 
 		 297 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  44.64 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  47.17 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3457  UspA domain-containing protein  25.71 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  56.41 
 
 		 293 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  26.39 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  29.37 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  26.35 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  29.11 
 
 		 217 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 		 298 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  45.28 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  28.86 
 
 		 298 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 		 298 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  28.37 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  29.93 
 
 		 322 aa  47.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>